HIST1H2BA

HIST1H2BA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3WKJ
Ідентифікатори
Символи	H2BC1, H2BFU, STBP, TSH2B, TSH2B.1, bA317E16.3, TH2B, histone cluster 1, H2ba, histone cluster 1 H2B family member a, hTSH2B, HIST1H2BA, H2B clustered histone 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609904 MGI: 2448375 HomoloGene: 69356 GeneCards: H2BC1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0031493 histone binding • молекулярна функція Клітинна компонента • Нуклеосома • extrinsic component of plasma membrane • клітинне ядро • хромосома • нуклеоплазма • DNA packaging complex Біологічний процес • mononuclear cell migration • nucleosome assembly • positive regulation of binding • nucleosome disassembly • plasminogen activation • inflammatory response • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	255626	319177
Ensembl	ENSG00000146047	ENSMUSG00000050799
UniProt	Q96A08	P70696
RefSeq (мРНК)	NM_170610	NM_175663
RefSeq (білок)	NP_733759	NP_783594
Локус (UCSC)	Хр. 6: 25.73 – 25.73 Mb	Хр. 13: 24.12 – 24.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST1H2BA (англ. Histone cluster 1 H2B family member a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 127 амінокислот, а молекулярна маса — 14 167.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPEVSSKGAT		ISKKGFKKAV		VKTQKKEGKK		RKRTRKESYS		IYIYKVLKQV
HPDTGISSKA		MSIMNSFVTD		IFERIASEAS		RLAHYSKRST		ISSREIQTAV
RLLLPGELAK		HAVSEGTKAV		TKYTSSK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Golebiowski F., Kasprzak K.S. (2005). Inhibition of core histones acetylation by carcinogenic nickel(II). Mol. Cell. Biochem. 279: 133—139. PMID 16283522 DOI:10.1007/s11010-005-8285-1
• Wu L., Zee B.M., Wang Y., Garcia B.A., Dou Y. (2011). The RING finger protein MSL2 in the MOF complex is an E3 ubiquitin ligase for H2B K34 and is involved in crosstalk with H3 K4 and K79 methylation. Mol. Cell. 43: 132—144. PMID 21726816 DOI:10.1016/j.molcel.2011.05.015
• Jufvas A., Stralfors P., Vener A.V. (2011). Histone variants and their post-translational modifications in primary human fat cells. PLoS ONE. 6: E15960—E15960. PMID 21249133 DOI:10.1371/journal.pone.0015960

Див. також

• Хромосома 6