HIST1H2BD

HIST1H2BD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5KGF
Ідентифікатори
Символи	H2BC5, H2B.1B, H2B/b, H2BFB, HIRIP2, dJ221C16.6, histone cluster 1, H2bd, histone cluster 1 H2B family member d, H2BFG, H2BFL, H2B/k, H2B/l, H2B/h, H2BFK, HIST1H2BE, HIST1H2BC, HIST1H2BG, HIST1H2BI, H2BFA, H2BFH, H2B/a, H2B/g, HIST1H2BF, HIST1H2BD, H2B clustered histone 5
Зовнішні ІД	OMIM: 602799 MGI: 1925553 HomoloGene: 134740 GeneCards: H2BC5
Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • DNA binding • молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • хромосома • Нуклеосома • екзосома • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • міжклітинний простір Біологічний процес • nucleosome assembly • Убіквітин-залежний протеоліз • innate immune response in mucosa • defense response to bacterium • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3017	78303
Ensembl	ENSG00000158373	ENSMUSG00000056895
UniProt	P58876 P62807	Q9D2U9
RefSeq (мРНК)	NM_021063 NM_138720	NM_030082
RefSeq (білок)	NP_066407 NP_619790 NP_003517 NP_001368918	NP_084358
Локус (UCSC)	Хр. 6: 26.16 – 26.17 Mb	Хр. 11: 58.84 – 58.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST1H2BD (англ. Histone cluster 1 H2B family member d) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 126 амінокислот, а молекулярна маса — 13 936.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPEPTKSAPA		PKKGSKKAVT		KAQKKDGKKR		KRSRKESYSV		YVYKVLKQVH
PDTGISSKAM		GIMNSFVNDI		FERIAGEASR		LAHYNKRSTI		TSREIQTAVR
LLLPGELAKH		AVSEGTKAVT		KYTSSK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes. Genomics. 10: 940—948. PMID 1916825 DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Golebiowski F., Kasprzak K.S. (2005). Inhibition of core histones acetylation by carcinogenic nickel(II). Mol. Cell. Biochem. 279: 133—139. PMID 16283522 DOI:10.1007/s11010-005-8285-1
• Siuti N., Roth M.J., Mizzen C.A., Kelleher N.L., Pesavento J.J. (2006). Gene-specific characterization of human histone H2B by electron capture dissociation. J. Proteome Res. 5: 233—239. PMID 16457587 DOI:10.1021/pr050268v
• Bonenfant D., Coulot M., Towbin H., Schindler P., van Oostrum J. (2006). Characterization of histones H2A and H2B variants and their post-translational modifications by mass spectrometry. Mol. Cell. Proteomics. 5: 541—552. PMID 16319397 DOI:10.1074/mcp.M500288-MCP200

Див. також

• Хромосома 6