HIST1H2BJ

HIST1H2BJ
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3A6N, 3AFA, 3AN2, 3AV1, 3AV2, 3AYW, 3AZE, 3AZF, 3AZG, 3AZH, 3AZI, 3AZJ, 3AZK, 3AZL, 3AZM, 3AZN, 3W96, 3W97, 3W98, 3W99, 3WA9, 3WAA, 3WTP, 4CAY, 5CPJ, 5B0Z, 4YM5, 5AV9, 5AVB, 5AV5, 4YM6, 5CPI, 5AV6, 5AV8, 5CPK, 5AVC, 5B0Y, 4Z5T, 5FUG, 5B24, 2RVQ, 5AY8, 5B2I, 5B40, 5B2J
Ідентифікатори
Символи	H2BC11, H2B/r, H2BFR, H2BJ, histone cluster 1, H2bj, histone cluster 1 H2B family member j, H2B clustered histone 11, HIST1H2BJ
Зовнішні ІД	OMIM: 615044 MGI: 2448415 HomoloGene: 128594 GeneCards: H2BC11
Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • DNA binding • lipopolysaccharide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Нуклеосома • клітинне ядро • хромосома • нуклеоплазма • міжклітинний простір • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • nucleosome assembly • innate immune response in mucosa • defense response to bacterium • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8970	319190
Ensembl	ENSG00000124635	ENSMUSG00000068854
UniProt	P06899	Q64524
RefSeq (мРНК)	NM_021058	NM_178214
RefSeq (білок)	NP_066402	NP_835586
Локус (UCSC)	Хр. 6: 27.13 – 27.13 Mb	Хр. 3: 96.13 – 96.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST1H2BJ (англ. Histone cluster 1 H2B family member j) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 126 амінокислот, а молекулярна маса — 13 904.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPEPAKSAPA		PKKGSKKAVT		KAQKKDGKKR		KRSRKESYSI		YVYKVLKQVH
PDTGISSKAM		GIMNSFVNDI		FERIAGEASR		LAHYNKRSTI		TSREIQTAVR
LLLPGELAKH		AVSEGTKAVT		KYTSAK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Zhong R., Roeder R.G., Heintz N. (1983). The primary structure and expression of four cloned human histone genes. Nucleic Acids Res. 11: 7409—7425. PMID 6647026 DOI:10.1093/nar/11.21.7409
• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• Howell S.J., Wilk D., Yadav S.P., Bevins C.L. (2003). Antimicrobial polypeptides of the human colonic epithelium. Peptides. 24: 1763—1770. PMID 15019208 DOI:10.1016/j.peptides.2003.07.028
• Galasinski S.C., Louie D.F., Gloor K.K., Resing K.A., Ahn N.G. (2002). Global regulation of post-translational modifications on core histones. J. Biol. Chem. 277: 2579—2588. PMID 11709551 DOI:10.1074/jbc.M107894200
• Golebiowski F., Kasprzak K.S. (2005). Inhibition of core histones acetylation by carcinogenic nickel(II). Mol. Cell. Biochem. 279: 133—139. PMID 16283522 DOI:10.1007/s11010-005-8285-1
• Wu L., Zee B.M., Wang Y., Garcia B.A., Dou Y. (2011). The RING finger protein MSL2 in the MOF complex is an E3 ubiquitin ligase for H2B K34 and is involved in crosstalk with H3 K4 and K79 methylation. Mol. Cell. 43: 132—144. PMID 21726816 DOI:10.1016/j.molcel.2011.05.015

Див. також

• Хромосома 6