HIST1H2BK

HIST1H2BK
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CV5
Ідентифікатори
Символи	H2BC12, H2B/S, H2BFAiii, H2BFT, H2BK, histone cluster 1, H2bk, histone cluster 1 H2B family member k, H2B clustered histone 12, HIST1H2BK
Зовнішні ІД	OMIM: 615045 MGI: 2448399 HomoloGene: 135980 GeneCards: H2BC12
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein heterodimerization activity • молекулярна функція Клітинна компонента • Нуклеоплазма • Нуклеосома • клітинне ядро • хромосома • міжклітинний простір • гіалоплазма Біологічний процес • nucleosome assembly • innate immune response in mucosa • defense response to bacterium • Убіквітин-залежний протеоліз • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	85236	319184
Ensembl	ENSG00000197903	ENSMUSG00000062727
UniProt	O60814	Q8CGP1
RefSeq (мРНК)	NM_080593 NM_001312653	NM_175665
RefSeq (білок)	NP_001299582 NP_542160	NP_783596
Локус (UCSC)	Хр. 6: 27.15 – 27.15 Mb	Хр. 13: 22.22 – 22.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST1H2BK (англ. Histone cluster 1 H2B family member k) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 126 амінокислот, а молекулярна маса — 13 890.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPEPAKSAPA		PKKGSKKAVT		KAQKKDGKKR		KRSRKESYSV		YVYKVLKQVH
PDTGISSKAM		GIMNSFVNDI		FERIAGEASR		LAHYNKRSTI		TSREIQTAVR
LLLPGELAKH		AVSEGTKAVT		KYTSAK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Howell S.J., Wilk D., Yadav S.P., Bevins C.L. (2003). Antimicrobial polypeptides of the human colonic epithelium. Peptides. 24: 1763—1770. PMID 15019208 DOI:10.1016/j.peptides.2003.07.028
• Golebiowski F., Kasprzak K.S. (2005). Inhibition of core histones acetylation by carcinogenic nickel(II). Mol. Cell. Biochem. 279: 133—139. PMID 16283522 DOI:10.1007/s11010-005-8285-1
• Wu L., Zee B.M., Wang Y., Garcia B.A., Dou Y. (2011). The RING finger protein MSL2 in the MOF complex is an E3 ubiquitin ligase for H2B K34 and is involved in crosstalk with H3 K4 and K79 methylation. Mol. Cell. 43: 132—144. PMID 21726816 DOI:10.1016/j.molcel.2011.05.015
• Tsunaka Y., Kajimura N., Tate S., Morikawa K. (2005). Alteration of the nucleosomal DNA path in the crystal structure of a human nucleosome core particle. Nucleic Acids Res. 33: 3424—3434. PMID 15951514 DOI:10.1093/nar/gki663

Див. також

• Хромосома 6