HIST2H2AA3

HIST2H2AA3
Ідентифікатори
Символи	H2AC18, H2A, H2A.2, H2A/O, H2A/q, H2AFO, H2a-615, HIST2H2AA, histone cluster 2, H2aa3, histone cluster 2 H2A family member a3, HIST2H2AA3, H2A clustered histone 18, H2AC19
Зовнішні ІД	OMIM: 142720 MGI: 2448283 HomoloGene: 116071 GeneCards: H2AC18
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein heterodimerization activity • молекулярна функція Клітинна компонента • Нуклеосома • екзосома • клітинне ядро • хромосома Біологічний процес • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8337	319192
Ensembl	ENSG00000288825	ENSMUSG00000063954
UniProt	Q6FI13	Q6GSS7
RefSeq (мРНК)	NM_003516	NM_178212
RefSeq (білок)	NP_001035807 NP_003507	NP_038577 NP_835584
Локус (UCSC)	Хр. 1: 149.84 – 149.84 Mb	Хр. 3: 96.15 – 96.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST2H2AA3 (англ. Histone cluster 2 H2A family member a4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 130 амінокислот, а молекулярна маса — 14 095.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGRGKQGGK		ARAKAKSRSS		RAGLQFPVGR		VHRLLRKGNY		AERVGAGAPV
YMAAVLEYLT		AEILELAGNA		ARDNKKTRII		PRHLQLAIRN		DEELNKLLGK
VTIAQGGVLP		NIQAVLLPKK		TESHHKAKGK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Y., Griffin K., Mondal N., Parvin J.D. (2004). Phosphorylation of histone H2A inhibits transcription on chromatin templates. J. Biol. Chem. 279: 21866—21872. PMID 15010469 DOI:10.1074/jbc.M400099200
• Hagiwara T., Hidaka Y., Yamada M. (2005). Deimination of histone H2A and H4 at arginine 3 in HL-60 granulocytes. Biochemistry. 44: 5827—5834. PMID 15823041 DOI:10.1021/bi047505c
• Cao R., Tsukada Y., Zhang Y. (2005). Role of Bmi-1 and Ring1A in H2A ubiquitylation and Hox gene silencing. Mol. Cell. 20: 845—854. PMID 16359901 DOI:10.1016/j.molcel.2005.12.002
• Boyne M.T. II, Pesavento J.J., Mizzen C.A., Kelleher N.L. (2006). Precise characterization of human histones in the H2A gene family by top down mass spectrometry. J. Proteome Res. 5: 248—253. PMID 16457589 DOI:10.1021/pr050269n

Див. також

• Хромосома 1