HIST2H2BE

HIST2H2BE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NFT
Ідентифікатори
Символи	H2BC21, GL105, H2B, H2B.1, H2BFQ, H2BGL105, H2BQ, histone cluster 2, H2be, histone cluster 2 H2B family member e, H2B clustered histone 21, HIST2H2BE, H2BE, H2B-GL105
Зовнішні ІД	OMIM: 601831 HomoloGene: 128426 GeneCards: H2BC21
Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • DNA binding Клітинна компонента • хромосома • екзосома • нуклеоплазма • Нуклеосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма Біологічний процес • nucleosome assembly • innate immune response in mucosa • defense response to bacterium • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8349	100333322
Ensembl	ENSG00000184678	ENSDARG00000111934
UniProt	Q16778	Q05AK8
RefSeq (мРНК)	NM_003528	XM_005170730
RefSeq (білок)	NP_003519	NP_001373681 NP_001373648 NP_001373497 NP_001019569
Локус (UCSC)	Хр. 1: 149.88 – 149.89 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST2H2BE (англ. Histone cluster 2 H2B family member e) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 126 амінокислот, а молекулярна маса — 13 920.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPEPAKSAPA		PKKGSKKAVT		KAQKKDGKKR		KRSRKESYSI		YVYKVLKQVH
PDTGISSKAM		GIMNSFVNDI		FERIAGEASR		LAHYNKRSTI		TSREIQTAVR
LLLPGELAKH		AVSEGTKAVT		KYTSSK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Howell S.J., Wilk D., Yadav S.P., Bevins C.L. (2003). Antimicrobial polypeptides of the human colonic epithelium. Peptides. 24: 1763—1770. PMID 15019208 DOI:10.1016/j.peptides.2003.07.028
• Golebiowski F., Kasprzak K.S. (2005). Inhibition of core histones acetylation by carcinogenic nickel(II). Mol. Cell. Biochem. 279: 133—139. PMID 16283522 DOI:10.1007/s11010-005-8285-1
• Siuti N., Roth M.J., Mizzen C.A., Kelleher N.L., Pesavento J.J. (2006). Gene-specific characterization of human histone H2B by electron capture dissociation. J. Proteome Res. 5: 233—239. PMID 16457587 DOI:10.1021/pr050268v
• Wu L., Zee B.M., Wang Y., Garcia B.A., Dou Y. (2011). The RING finger protein MSL2 in the MOF complex is an E3 ubiquitin ligase for H2B K34 and is involved in crosstalk with H3 K4 and K79 methylation. Mol. Cell. 43: 132—144. PMID 21726816 DOI:10.1016/j.molcel.2011.05.015

Див. також

• Хромосома 1