HNRNPLL

HNRNPLL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WEX, 2E5I
Ідентифікатори
Символи	HNRNPLL, HNRPLL, SRRF, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like
Зовнішні ІД	OMIM: 611208 MGI: 1919942 HomoloGene: 26701 GeneCards: HNRNPLL
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of RNA splicing • mRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	92906	72692
Ensembl	ENSG00000143889	ENSMUSG00000024095
UniProt	Q8WVV9	Q921F4
RefSeq (мРНК)	NM_001142650 NM_138394	NM_144802
RefSeq (білок)	NP_001136122 NP_612403	NP_659051
Локус (UCSC)	Хр. 2: 38.56 – 38.6 Mb	Хр. 17: 80.34 – 80.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HNRNPLL (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 542 амінокислот, а молекулярна маса — 60 083.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSSSSSPRE		TYEEDREYES		QAKRLKTEEG		EIDYSAEEGE		NRREATPRGG
GDGGGGGRSF		SQPEAGGSHH		KVSVSPVVHV		RGLCESVVEA		DLVEALEKFG
TICYVMMMPF		KRQALVEFEN		IDSAKECVTF		AADEPVYIAG		QQAFFNYSTS
KRITRPGNTD		DPSGGNKVLL		LSIQNPLYPI		TVDVLYTVCN		PVGKVQRIVI
FKRNGIQAMV		EFESVLCAQK		AKAALNGADI		YAGCCTLKIE		YARPTRLNVI
RNDNDSWDYT		KPYLGRRDRG		KGRQRQAILG		EHPSSFRHDG		YGSHGPLLPL
PSRYRMGSRD		TPELVAYPLP		QASSSYMHGG		NPSGSVVMVS		GLHQLKMNCS
RVFNLFCLYG		NIEKVKFMKT		IPGTALVEMG		DEYAVERAVT		HLNNVKLFGK
RLNVCVSKQH		SVVPSQIFEL		EDGTSSYKDF		AMSKNNRFTS		AGQASKNIIQ
PPSCVLHYYN		VPLCVTEETF		TKLCNDHEVL		TFIKYKVFDA		KPSAKTLSGL
LEWECKTDAV		EALTALNHYQ		IRVPNGSNPY		TLKLCFSTSS		HL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.

Література

• Shur I., Ben-Avraham D., Benayahu D. (2004). Alternatively spliced isoforms of a novel stromal RNA regulating factor. Gene. 334: 113—121. PMID 15256261 DOI:10.1016/j.gene.2004.03.012
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2