HOMER2

HOMER2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1I7A
Ідентифікатори
Символи	HOMER2, ACPD, CPD, HOMER-2, VESL-2, DFNA68, homer scaffolding protein 2, homer scaffold protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604799 MGI: 1347354 HomoloGene: 3560 GeneCards: HOMER2
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant nonsyndromic deafness 68
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • synaptic receptor adaptor activity • actin binding • G protein-coupled glutamate receptor binding • glutamate receptor binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • цитоплазма • neuronal cell body • postsynaptic membrane • дендрит (нейробіологія) • синапс • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • apical part of cell • stereocilium tip • cell projection • stereocilium • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • гіалоплазма • glutamatergic synapse • neuron projection Біологічний процес • G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • chemical homeostasis within a tissue • behavioral response to cocaine • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • слух • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • negative regulation of interleukin-2 production • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • regulation of store-operated calcium entry • positive regulation of signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9455	26557
Ensembl	ENSG00000103942	ENSMUSG00000025813
UniProt	Q9NSB8	Q9QWW1
RefSeq (мРНК)	NM_004839 NM_199330 NM_199331 NM_199332	NM_001164086 NM_001164087 NM_011983 NM_177029
RefSeq (білок)	NP_004830 NP_955362	NP_001157558 NP_001157559 NP_036113
Локус (UCSC)	Хр. 15: 82.84 – 82.99 Mb	Хр. 7: 81.25 – 81.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOMER2 (англ. Homer scaffolding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 40 627.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEQPIFTTR		AHVFQIDPNT		KKNWMPASKQ		AVTVSYFYDV		TRNSYRIISV
DGAKVIINST		ITPNMTFTKT		SQKFGQWADS		RANTVFGLGF		SSEQQLTKFA
EKFQEVKEAA		KIAKDKTQEK		IETSSNHSQE		SGRETPSSTQ		ASSVNGTDDE
KASHAGPANT		HLKSENDKLK		IALTQSAANV		KKWEIELQTL		RESNARLTTA
LQESAASVEQ		WKRQFSICRD		ENDRLRNKID		ELEEQCSEIN		REKEKNTQLK
RRIEELEAEL		REKETELKDL		RKQSEIIPQL		MSECEYVSEK		LEAAERDNQN
LEDKVRSLKT		DIEESKYRQR		HLKVELKSFL		EVLDGKIDDL		HDFRRGLSKL
GTDN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

• Soloviev M., Ciruela F., Chan W.-Y., McIlhinney R.A.J. (2000). Molecular characterisation of two structurally distinct groups of human homers, generated by extensive alternative splicing. J. Mol. Biol. 295: 1185—1200. PMID 10653696 DOI:10.1006/jmbi.1999.3436
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15