HOOK1

HOOK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WIX
Ідентифікатори
Символи	HOOK1, HK1, hook microtubule-tethering protein 1, hook microtubule tethering protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607820 MGI: 1925213 HomoloGene: 9289 GeneCards: HOOK1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • microtubule binding • dynein light intermediate chain binding Клітинна компонента • HOPS complex • цитоплазма • microtubule cytoskeleton • мікротрубочка • Цитоскелет • FHF complex • гіалоплазма • центросома Біологічний процес • multicellular organism development • protein transport • диференціація клітин • lysosome organization • early endosome to late endosome transport • Сперматогенез • endosome organization • spermatid development • endosome to lysosome transport • cytoskeleton-dependent intracellular transport • cytoplasmic microtubule organization • Golgi organization • manchette assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51361	77963
Ensembl	ENSG00000134709	ENSMUSG00000028572
UniProt	Q9UJC3	Q8BIL5
RefSeq (мРНК)	NM_015888	NM_030014
RefSeq (білок)	NP_056972	NP_084290
Локус (UCSC)	Хр. 1: 59.81 – 59.88 Mb	Хр. 4: 95.86 – 95.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOOK1 (англ. Hook microtubule tethering protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 728 амінокислот, а молекулярна маса — 84 648.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEETQPPPQP		KLPLCDSLMI		WLQTFNTASP		CQDVKQLTSG		VAMAQVLHQI
DAAWFNESWL		SRIKEDVGDN		WRIKASNVKK		VLQGIMSYYH		EFLGQQISEA
LIPDLNQITE		CSDPVELGRL		LQLILGCAIN		CEKKQEHIQN		IMTLEESVQH
VVMTAIQELM		SKEILSSPPN		DAVGELEQQL		KRALEELQEA		LAEKEELRQR
CEELDMQVTT		LQDEKNSLVS		ENEMMNEKLD		QLDGSFDDPN		TVVAKKYFHA
QLQLEQLQEE		NFRLEAAKDD		YRVHCEELEK		QLIEFQHRND		ELTSLAEETR
ALKDEIDVLR		ATSDKANKLE		STVEIYRQKL		QDLNDLRKQV		KTLQETNMMY
MHNTVSLEEE		LKKANAARTQ		LETYKRQVQD		LHVKLSSESK		RADTLAFEMK
RLEEKHEALL		KEKERLIEQR		DTLKETNEEL		RCSQVQQDHL		NQTDASATKS
YENLAAEIMP		VEYREVFIRL		QHENKMLRLQ		QEGSENERIE		ELQEQLEQKH
RKMNELETEQ		RLSKERIREL		QQQIEDLQKS		LQEQGSKSEG		ESSSKLKQKL
EAHMEKLTEV		HEELQKKQEL		IEDLQPDINQ		NVQKINELEA		ALQKKDEDMK
AMEERYKMYL		EKARNVIKTL		DPKLNPASAE		IMLLRKQLAE		KERRIEILES
ECKVAKFRDY		EEKLIVSAWY		NKSLAFQKLG		MESRLVSGGG		ACSDTGACTP
ARSFLAQQRH		ITNTRRNLSV		KVPATTSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, диференціація, сперматогенез, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Walenta J.H., Didier A.J., Liu X., Kraemer H. (2001). The Golgi-associated hook3 protein is a member of a novel family of microtubule-binding proteins. J. Cell Biol. 152: 923—934. PMID 11238449 DOI:10.1083/jcb.152.5.923
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Kraemer H., Phistry M. (1999). Genetic analysis of hook, a gene required for endocytic trafficking in Drosophila. Genetics. 151: 675—684. PMID 9927460

Див. також

• Хромосома 1