HPGD

HPGD
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2GDZ
Ідентифікатори
Символи	HPGD, 15-PGDH, PGDH, PGDH1, PHOAR1, SDR36C1, hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15-(NAD), 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase
Зовнішні ІД	OMIM: 601688 MGI: 108085 HomoloGene: 68095 GeneCards: HPGD
Пов'язані генетичні захворювання
	acropachy, hypertrophic osteoarthropathy, primary, autosomal recessive, 1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• NAD binding; • 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (NAD+) activity; • каталітична активність; • prostaglandin E receptor activity; • NAD+ binding; • oxidoreductase activity; • protein homodimerization activity;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • basolateral plasma membrane; • екзосома; • цитоплазма; • гіалоплазма; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• prostaglandin metabolic process; • thrombin-activated receptor signaling pathway; • lipid metabolism; • negative regulation of cell cycle; • fatty acid metabolic process; • lipoxygenase pathway; • народження; • lipoxin metabolic process; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • овуляція; • ductus arteriosus closure; • response to lipopolysaccharide; • розвиток нирки; • жіноча вагітність; • response to estradiol; • positive regulation of apoptotic process; • response to ethanol; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; • long-chain fatty acid biosynthetic process; • lipoxin biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3248
	15446
	ENSG00000164120
	ENSMUSG00000031613
	P15428
	Q8VCC1
NM_000860; NM_001145816; NM_001256301; NM_001256305; NM_001256306;
	NM_001256307; NM_001363574
	NM_008278
NP_000851; NP_001139288; NP_001243230; NP_001243234; NP_001243235;
	NP_001243236; NP_001350503
	NP_032304
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HPGD (англ. Hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15-(NAD)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 28 977^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHVNGKVALV	TGAAQGIGRA	FAEALLLKGA	KVALVDWNLE	AGVQCKAALD
EQFEPQKTLF	IQCDVADQQQ	LRDTFRKVVD	HFGRLDILVN	NAGVNNEKNW
EKTLQINLVS	VISGTYLGLD	YMSKQNGGEG	GIIINMSSLA	GLMPVAQQPV
YCASKHGIVG	FTRSAALAAN	LMNSGVRLNA	ICPGFVNTAI	LESIEKEENM
GQYIEYKDHI	KDMIKYYGIL	DPPLIANGLI	TLIEDDALNG	AIMKITTSKG
IHFQDYDTTP	FQAKTQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, метаболізм простагландинів, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Krook M., Marekov L., Joernvall H. (1990). Purification and structural characterization of placental NAD(+)-linked 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase. The primary structure reveals the enzyme to belong to the short-chain alcohol dehydrogenase family. Biochemistry. 29: 738—743. PMID 2337593 DOI:10.1021/bi00455a021
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ensor C.M., Tai H.-H. (1991). Site-directed mutagenesis of the conserved tyrosine 151 of human placental NAD(+)-dependent 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase yields a catalytically inactive enzyme. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176: 840—845. PMID 2025296 DOI:10.1016/S0006-291X(05)80262-1
Clish C.B., Levy B.D., Chiang N., Tai H.-H., Serhan C.N. (2000). Oxidoreductases in lipoxin A4 metabolic inactivation: a novel role for 15-onoprostaglandin 13-reductase/leukotriene B4 12-hydroxydehydrogenase in inflammation. J. Biol. Chem. 275: 25372—25380. PMID 10837478 DOI:10.1074/jbc.M002863200
Patel F.A., Funder J.W., Challis J.R.G. (2003). Mechanism of cortisol/progesterone antagonism in the regulation of 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase activity and messenger ribonucleic acid levels in human chorion and placental trophoblast cells at term. J. Clin. Endocrinol. Metab. 88: 2922—2933. PMID 12788907 DOI:10.1210/jc.2002-021710
Krook M., Ghosh D., Duax W.L., Joernvall H. (1993). Three-dimensional model of NAD(+)-dependent 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase and relationships to the NADP(+)-dependent enzyme (carbonyl reductase). FEBS Lett. 322: 139—142. PMID 8482380 DOI:10.1016/0014-5793(93)81554-D

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HPGD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5154 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P15428 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HPGD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5154 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P15428 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

HPGD

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук