IFNW1

IFNW1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3SE4
Ідентифікатори
Символи	IFNW1, interferon omega 1
Зовнішні ІД	OMIM: 147553 HomoloGene: 105922 GeneCards: IFNW1
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • type I interferon receptor binding • GO:0005145 cytokine receptor binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • natural killer cell activation involved in immune response • B cell differentiation • defense response • B cell proliferation • response to virus • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein • humoral immune response • адаптивна імунна відповідь • defense response to virus • response to exogenous dsRNA • cytokine-mediated signaling pathway • T cell activation involved in immune response • вроджений імунітет • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3467	н/д
Ensembl	ENSG00000177047	н/д
UniProt	P05000	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_002177	н/д
RefSeq (білок)	NP_002168	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 9: 21.14 – 21.14 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

IFNW1 (англ. Interferon omega 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 195 амінокислот, а молекулярна маса — 22 319.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALLFPLLAA		LVMTSYSPVG		SLGCDLPQNH		GLLSRNTLVL		LHQMRRISPF
LCLKDRRDFR		FPQEMVKGSQ		LQKAHVMSVL		HEMLQQIFSL		FHTERSSAAW
NMTLLDQLHT		GLHQQLQHLE		TCLLQVVGEG		ESAGAISSPA		LTLRRYFQGI
RVYLKEKKYS		DCAWEVVRME		IMKSLFLSTN		MQERLRSKDR		DLGSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як противірусний захист. Секретований назовні.

Література

• Capon D.J., Shepard H.M., Goeddel D.V. (1985). Two distinct families of human and bovine interferon-alpha genes are coordinately expressed and encode functional polypeptides. Mol. Cell. Biol. 5: 768—779. PMID 2985969 DOI:10.1128/MCB.5.4.768
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hauptmann R., Swetly P. (1985). A novel class of human type I interferons. Nucleic Acids Res. 13: 4739—4749. PMID 3895159 DOI:10.1093/nar/13.13.4739
• Shirono H., Koga J., Uemura H., Matsuo A. (1994). Identification of glycosylated subtypes of interferon-alpha produced by human leukocytes. Biosci. Biotechnol. Biochem. 58: 1714—1715. PMID 7765487 DOI:10.1271/bbb.58.1714
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Li M.F., Zeng Q., Zhou Y., Guo H.Y., Hou Y.D. (1993). Cloning, sequencing and expression in E. coli of interferon-omega 1 gene. Sci. China, Ser. B, Chem. Life Sci. Earth Sci. 36: 1361—1366. PMID 8142025

Див. також

• Хромосома 9