IFT122

IFT122
Ідентифікатори
Символи	IFT122, CED, CED1, SPG, WDR10, WDR10p, WDR140, intraflagellar transport 122, FAP80
Зовнішні ІД	OMIM: 606045 MGI: 1932386 HomoloGene: 12819 GeneCards: IFT122
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • ciliary basal body • cell projection • мембрана • intraciliary transport particle A • photoreceptor connecting cilium • ciliary base • ciliary tip • Цитоскелет • Нуклеоплазма • гіалоплазма • Війка Біологічний процес • intraciliary anterograde transport • negative regulation of smoothened signaling pathway • embryonic body morphogenesis • embryonic heart tube left/right pattern formation • embryonic digit morphogenesis • ciliary receptor clustering involved in smoothened signaling pathway • negative regulation of smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord patterning • signal transduction downstream of smoothened • embryonic heart tube development • limb development • multicellular organism development • neural tube closure • smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning • cell projection organization • protein localization to cilium • negative regulation of epithelial cell proliferation • intraciliary retrograde transport • establishment of protein localization to organelle • dorsal/ventral pattern formation • embryonic forelimb morphogenesis • camera-type eye morphogenesis • intraciliary transport involved in cilium assembly • non-motile cilium assembly • cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55764	81896
Ensembl	ENSG00000163913	ENSMUSG00000030323
UniProt	Q9HBG6	Q6NWV3
RefSeq (мРНК)	NM_001280541 NM_001280545 NM_001280546 NM_018262 NM_052985 NM_052989 NM_052990	NM_001167763 NM_031177
RefSeq (білок)	NP_001267470 NP_001267474 NP_001267475 NP_060732 NP_443711 NP_443715 NP_443716	NP_001161235 NP_112454
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.43 – 129.52 Mb	Хр. 6: 115.83 – 115.9 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IFT122 (англ. Intraflagellar transport 122) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 241 амінокислот, а молекулярна маса — 141 825.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRAVLTWRDK		AEHCINDIAF		KPDGTQLILA		AGSRLLVYDT		SDGTLLQPLK
GHKDTVYCVA		YAKDGKRFAS		GSADKSVIIW		TSKLEGILKY		THNDAIQCVS
YNPITHQLAS		CSSSDFGLWS		PEQKSVSKHK		SSSKIICCSW		TNDGQYLALG
MFNGIISIRN		KNGEEKVKIE		RPGGSLSPIW		SICWNPSSRW		ESFWMNRENE
DAEDVIVNRY		IQEIPSTLKS		AVYSSQGSEA		EEEEPEEEDD		SPRDDNLEER
NDILAVADWG		QKVSFYQLSG		KQIGKDRALN		FDPCCISYFT		KGEYILLGGS
DKQVSLFTKD		GVRLGTVGEQ		NSWVWTCQAK		PDSNYVVVGC		QDGTISFYQL
IFSTVHGLYK		DRYAYRDSMT		DVIVQHLITE		QKVRIKCKEL		VKKIAIYRNR
LAIQLPEKIL		IYELYSEDLS		DMHYRVKEKI		IKKFECNLLV		VCANHIILCQ
EKRLQCLSFS		GVKEREWQME		SLIRYIKVIG		GPPGREGLLV		GLKNGQILKI
FVDNLFAIVL		LKQATAVRCL		DMSASRKKLA		VVDENDTCLV		YDIDTKELLF
QEPNANSVAW		NTQCEDMLCF		SGGGYLNIKA		STFPVHRQKL		QGFVVGYNGS
KIFCLHVFSI		SAVEVPQSAP		MYQYLDRKLF		KEAYQIACLG		VTDTDWRELA
MEALEGLDFE		TAKKAFIRVQ		DLRYLELISS		IEERKKRGET		NNDLFLADVF
SYQGKFHEAA		KLYKRSGHEN		LALEMYTDLC		MFEYAKDFLG		SGDPKETKML
ITKQADWARN		IKEPKAAVEM		YISAGEHVKA		IEICGDHGWV		DMLIDIARKL
DKAEREPLLL		CATYLKKLDS		PGYAAETYLK		MGDLKSLVQL		HVETQRWDEA
FALGEKHPEF		KDDIYMPYAQ		WLAENDRFEE		AQKAFHKAGR		QREAVQVLEQ
LTNNAVAESR		FNDAAYYYWM		LSMQCLDIAQ		DPAQKDTMLG		KFYHFQRLAE
LYHGYHAIHR		HTEDPFSVHR		PETLFNISRF		LLHSLPKDTP		SGISKVKILF
TLAKQSKALG		AYRLARHAYD		KLRGLYIPAR		FQKSIELGTL		TIRAKPFHDS
EELVPLCYRC		STNNPLLNNL		GNVCINCRQP		FIFSASSYDV		LHLVEFYLEE
GITDEEAISL		IDLEVLRPKR		DDRQLEIANN		SSQILRLVET		KDSIGDEDPF
TAKLSFEQGG		SEFVPVVVSR		LVLRSMSRRD		VLIKRWPPPL		RWQYFRSLLP
DASITMCPSC		FQMFHSEDYE		LLVLQHGCCP		YCRRCKDDPG		P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

• Gross C., De Baere E., Lo A., Chang W., Messiaen L. (2001). Cloning and characterization of human WDR10, a novel gene located at 3q21 encoding a WD-repeat protein that is highly expressed in pituitary and testis. DNA Cell Biol. 20: 41—52. PMID 11242542 DOI:10.1089/10445490150504684
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3