IFT140

IFT140
Ідентифікатори
Символи	IFT140, MZSDS, SRTD9, WDTC2, c305C8.4, c380F5.1, gs114, intraflagellar transport 140, RP80
Зовнішні ІД	OMIM: 614620 MGI: 2146906 HomoloGene: 40979 GeneCards: IFT140
Пов'язані генетичні захворювання
short-rib thoracic dysplasia 9 with or without polydactyly
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • ciliary basal body • центросома • cell projection • photoreceptor outer segment • intraciliary transport particle A • photoreceptor connecting cilium • центр організації мікротрубочок • ciliary tip • GO:0035085 Аксонема • цитоскелет • війка • non-motile cilium Біологічний процес • renal system development • cilium assembly • limb morphogenesis • intraciliary transport • skeletal system morphogenesis • photoreceptor cell outer segment organization • neural tube patterning • regulation of smoothened signaling pathway • heart development • determination of left/right symmetry • cell projection organization • retina development in camera-type eye • protein localization to cilium • regulation of cilium assembly • intraciliary retrograde transport • embryonic camera-type eye development • intraciliary transport involved in cilium assembly • embryonic digit morphogenesis • embryonic cranial skeleton morphogenesis • non-motile cilium assembly • embryonic brain development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9742	106633
Ensembl	ENSG00000187535	ENSMUSG00000024169
UniProt	Q96RY7	E9PY46
RefSeq (мРНК)	NM_014714	NM_134126
RefSeq (білок)	NP_055529	NP_598887
Локус (UCSC)	Хр. 16: 1.51 – 1.61 Mb	Хр. 17: 25.24 – 25.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IFT140 (англ. Intraflagellar transport 140) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 462 амінокислот, а молекулярна маса — 165 193.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALYYDHQIE		APDAAGSPSF		ISWHPVHPFL		AVAYISTTST		GSVDIYLEQG
ECVPDTHVER		PFRVASLCWH		PTRLVLAVGW		ETGEVTVFNK		QDKEQHTMPL
THTADITVLR		WSPSGNCLLS		GDRLGVLLLW		RLDQRGRVQG		TPLLKHEYGK
HLTHCIFRLP		PPGEDLVQLA		KAAVSGDEKA		LDMFNWKKSS		SGSLLKMGSH
EGLLFFVSLM		DGTVHYVDEK		GKTTQVVSAD		STIQMLFYME		KREALVVVTE
NLRLSLYTVP		PEGKAEEVMK		VKLSGKTGRR		ADIALIEGSL		LVMAVGEAAL
RFWDIERGEN		YILSPDEKFG		FEKGENMNCV		CYCKVKGLLA		AGTDRGRVAM
WRKVPDFLGS		PGAEGKDRWA		LQTPTELQGN		ITQIQWGSRK		NLLAVNSVIS
VAILSERAMS		SHFHQQVAAM		QVSPSLLNVC		FLSTGVAHSL		RTDMHISGVF
ATKDAVAVWN		GRQVAIFELS		GAAIRSAGTF		LCETPVLAMH		EENVYTVESN
RVQVRTWQGT		VKQLLLFSET		EGNPCFLDIC		GNFLVVGTDL		AHFKSFDLSR
REAKAHCSCR		SLAELVPGVG		GIASLRCSSS		GSTISILPSK		ADNSPDSKIC
FYDVEMDTVT		VFDFKTGQID		RRETLSFNEQ		ETNKSHLFVD		EGLKNYVPVN
HFWDQSEPRL		FVCEAVQETP		RSQPQSANGQ		PQDGRAGPAA		DVLILSFFIS
EEHGFLLHES		FPRPATSHSL		LGMEVPYYYF		TRKPEEADRE		DEVEPGCHHI
PQMVSRRPLR		DFVGLEDCDK		ATRDAMLHFS		FFVTIGDMDE		AFKSIKLIKS
EAVWENMARM		CVKTQRLDVA		KVCLGNMGHA		RGARALREAE		QEPELEARVA
VLATQLGMLE		DAEQLYRKCK		RHDLLNKFYQ		AAGRWQEALQ		VAEHHDRVHL
RSTYHRYAGH		LEASADCSRA		LSYYEKSDTH		RFEVPRMLSE		DLPSLELYVN
KMKDKTLWRW		WAQYLESQGE		MDAALHYYEL		ARDHFSLVRI		HCFQGNVQKA
AQIANETGNL		AASYHLARQY		ESQEEVGQAV		HFYTRAQAFK		NAIRLCKENG
LDDQLMNLAL		LSSPEDMIEA		ARYYEEKGVQ		MDRAVMLYHK		AGHFSKALEL
AFATQQFVAL		QLIAEDLDET		SDPALLARCS		DFFIEHSQYE		RAVELLLAAR
KYQEALQLCL		GQNMSITEEM		AEKMTVAKDS		SDLPEESRRE		LLEQIADCCM
RQGSYHLATK		KYTQAGNKLK		AMRALLKSGD		TEKITFFASV		SRQKEIYIMA
ANYLQSLDWR		KEPEIMKNII		GFYTKGRALD		LLAGFYDACA		QVEIDEYQNY
DKAHGALTEA		YKCLAKAKAK		SPLDQETRLA		QLQSRMALVK		RFIQARRTYT
EDPKESIKQC		ELLLEEPDLD		STIRIGDVYG		FLVEHYVRKE		EYQTAYRFLE
EMRRRLPLAN		MSYYVSPQAV		DAVHRGLGLP		LPRTVPEQVR		HNSMEDAREL
DEEVVEEADD		DP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16