IFT20

IFT20
Ідентифікатори
Символи	IFT20, intraflagellar transport 20
Зовнішні ІД	OMIM: 614394 MGI: 1915585 HomoloGene: 49559 GeneCards: IFT20
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • opsin binding Клітинна компонента • cis-Golgi network • Golgi membrane • Центріоль • dendrite terminus • ciliary base • ciliary basal body • motile cilium • цитоплазма • photoreceptor connecting cilium • цитоскелет • cell projection • ciliary tip • photoreceptor outer segment • центросома • stereocilium • Мікроворсинки • intraciliary transport particle B • комплекс Ґольджі • kinociliary basal body • війка Біологічний процес • smoothened signaling pathway • cell projection organization • Нейрогенез • neural precursor cell proliferation • photoreceptor cell outer segment organization • cardiac muscle cell differentiation • розвиток нирки • protein localization to Golgi apparatus • opsin transport • regulation of canonical Wnt signaling pathway • visual learning • regulation of autophagosome assembly • regulation of cilium assembly • establishment of planar polarity • inner ear receptor cell stereocilium organization • protein localization to cilium • centrosome localization • cochlea development • intraciliary transport • intraciliary transport involved in cilium assembly • cilium assembly • protein localization to plasma membrane • Сперматогенез • regulation of platelet-derived growth factor receptor-alpha signaling pathway • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	90410	55978
Ensembl	ENSG00000109083	ENSMUSG00000001105
UniProt	Q8IY31	Q61025
RefSeq (мРНК)	NM_174887 NM_001267774 NM_001267775 NM_001267776 NM_001267777 NM_001267778	NM_018854
RefSeq (білок)	NP_001254703 NP_001254704 NP_001254705 NP_001254706 NP_001254707 NP_777547	NP_061342
Локус (UCSC)	Хр. 17: 28.33 – 28.34 Mb	Хр. 11: 78.43 – 78.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IFT20 (англ. Intraflagellar transport 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 132 амінокислот, а молекулярна маса — 15 281.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKDILGEAG		LHFDELNKLR		VLDPEVTQQT		IELKEECKDF		VDKIGQFQKI
VGGLIELVDQ		LAKEAENEKM		KAIGARNLLK		SIAKQREAQQ		QQLQALIAEK
KMQLERYRVE		YEALCKVEAE		QNEFIDQFIF		QK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Follit J.A., Tuft R.A., Fogarty K.E., Pazour G.J. (2006). The intraflagellar transport protein IFT20 is associated with the Golgi complex and is required for cilia assembly. Mol. Biol. Cell. 17: 3781—3792. PMID 16775004 DOI:10.1091/mbc.E06-02-0133

Див. також

• Хромосома 17