IMPG1

IMPG1
Ідентифікатори
Символи	IMPG1, GP147, IPM150, SPACR, VMD4, interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, RP91
Зовнішні ІД	OMIM: 602870 MGI: 1926876 HomoloGene: 1201 GeneCards: IMPG1
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • зір Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3617	63859
Ensembl	ENSG00000112706	ENSMUSG00000032343
UniProt	Q17R60	Q8R1W8
RefSeq (мРНК)	NM_001563 NM_001282368	NM_022016
RefSeq (білок)	NP_001269297 NP_001554	NP_071299
Локус (UCSC)	Хр. 6: 75.92 – 76.07 Mb	Хр. 9: 80.22 – 80.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IMPG1 (англ. Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 89 387.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYLETRRAIF		VFWIFLQVQG		TKDISINIYH		SETKDIDNPP		RNETTESTEK
MYKMSTMRRI		FDLAKHRTKR		SAFFPTGVKV		CPQESMKQIL		DSLQAYYRLR
VCQEAVWEAY		RIFLDRIPDT		GEYQDWVSIC		QQETFCLFDI		GKNFSNSQEH
LDLLQQRIKQ		RSFPDRKDEI		SAEKTLGEPG		ETIVISTDVA		NVSLGPFPLT
PDDTLLNEIL		DNTLNDTKMP		TTERETEFAV		LEEQRVELSV		SLVNQKFKAE
LADSQSPYYQ		ELAGKSQLQM		QKIFKKLPGF		KKIHVLGFRP		KKEKDGSSST
EMQLTAIFKR		HSAEAKSPAS		DLLSFDSNKI		ESEEVYHGTM		EEDKQPEIYL
TATDLKRLIS		KALEEEQSLD		VGTIQFTDEI		AGSLPAFGPD		TQSELPTSFA
VITEDATLSP		ELPPVEPQLE		TVDGAEHGLP		DTSWSPPAMA		STSLSEAPPF
FMASSIFSLT		DQGTTDTMAT		DQTMLVPGLT		IPTSDYSAIS		QLALGISHPP
ASSDDSRSSA		GGEDMVRHLD		EMDLSDTPAP		SEVPELSEYV		SVPDHFLEDT
TPVSALQYIT		TSSMTIAPKG		RELVVFFSLR		VANMAFSNDL		FNKSSLEYRA
LEQQFTQLLV		PYLRSNLTGF		KQLEILNFRN		GSVIVNSKMK		FAKSVPYNLT
KAVHGVLEDF		RSAAAQQLHL		EIDSYSLNIE		PADQADPCKF		LACGEFAQCV
KNERTEEAEC		RCKPGYDSQG		SLDGLEPGLC		GPGTKECEVL		QGKGAPCRLP
DHSENQAYKT		SVKKFQNQQN		NKVISKRNSE		LLTVEYEEFN		HQDWEGN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Секретований назовні.

Література

• Kuehn M.H., Hageman G.S. (1999). Expression and characterization of the IPM 150 gene (IMPG1) product, a novel human photoreceptor cell-associated chondroitin-sulfate proteoglycan. Matrix Biol. 18: 509—518. PMID 10601738 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00043-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Acharya S., Rayborn M.E., Hollyfield J.G. (1998). Characterization of SPACR, a sialoprotein associated with cones and rods present in the interphotoreceptor matrix of the human retina: immunological and lectin binding analysis. Glycobiology. 8: 997—1006. PMID 9719680 DOI:10.1093/glycob/8.10.997

Див. також

• Хромосома 6