IPP

IPP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XN4, 4CHB
Ідентифікатори
Символи	IPP, KLHL27, intracisternal A particle-promoted polypeptide
Зовнішні ІД	OMIM: 147485 MGI: 96581 HomoloGene: 4309 GeneCards: IPP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • actin binding Клітинна компонента • цитоплазма • actin cytoskeleton • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • цитоскелет Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3652	16351
Ensembl	ENSG00000197429	ENSMUSG00000028696
UniProt	Q9Y573	P28575
RefSeq (мРНК)	NM_001145349 NM_005897	NM_008389
RefSeq (білок)	NP_001138821 NP_005888	NP_032415
Локус (UCSC)	Хр. 1: 45.69 – 45.75 Mb	Хр. 4: 116.36 – 116.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IPP (англ. Intracisternal A particle-promoted polypeptide) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 584 амінокислот, а молекулярна маса — 65 261.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANEDCPKAA		DSPFSSDKHA		QLILAQINKM		RNGQHFCDVQ		LQVGQESFKA
HRLVLAASSP		YFAALFTGGM		KESSKDVVPI		LGIEAGIFQI		LLDFIYTGIV
NIGVNNVQEL		IIAADMLQLT		EVVHLCCEFL		KGQIDPLNCI		GIFQFSEQIA
CHDLLEFSEN		YIHVHFLEVH		SGEEFLALTK		DQLIKILRSE		ELSIEDEYQV
FLAAMQWILK		DLGKRRKHVV		EVLDPIRFPL		LPPQRLLKYI		EGVSDFNLRV
ALQTLLKEYC		EVCKSPKENK		FCSFLQTSKV		RPRKKARKYL		YAVGGYTRLQ
GGRWSDSRAL		SCVERFDTFS		QYWTTVSSLH		QARSGLGVTV		LGGMVYAIGG
EKDSMIFDCT		ECYDPVTKQW		TTVASMNHPR		CGLGVCVCYG		AIYALGGWVG
AEIGNTIERF		DPDENKWEVV		GNMAVSRYYF		GCCEMQGLIY		VIGGISNEGI
ELRSFEVYDP		LSKRWSPLPP		MGTRRAYLGV		AALNDCIYSV		GGWNETQDAL
HTVEKYSFEE		EKWVEVASMK		VPRAGMCVVA		VNGLLYVSGG		RSSSHDFLAP
GTLDSVEVYN		PHSDTWTEIG		NMITSRCEGG		VAVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Kim I.F., Mohammadi E., Huang R.C. (1999). Isolation and characterization of IPP, a novel human gene encoding an actin-binding, kelch-like protein. Gene. 228: 73—83. PMID 10072760 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00006-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chang-Yeh A., Jabs E.W., Li X., Dracopoli N.C., Huang R.C. (1993). The IPP gene is assigned to human chromosome 1p32-1p22. Genomics. 15: 239—241. PMID 8432546 DOI:10.1006/geno.1993.1048

Див. також

• Хромосома 1