JADE2

JADE2
Ідентифікатори
Символи	JADE2, JADE-2, PHF15, jade family PHD finger 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610515 MGI: 1924151 HomoloGene: 9082 GeneCards: JADE2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • histone acetyltransferase complex • екзосома • нуклеоплазма Біологічний процес • histone H4-K16 acetylation • histone H4-K8 acetylation • histone H4-K12 acetylation • histone H3 acetylation • histone H4-K5 acetylation • Убіквітин-залежний протеоліз • SMAD protein signal transduction • protein polyubiquitination • regulation of neurogenesis • positive regulation of neurogenesis • protein autoubiquitination • neuron projection extension Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23338	76901
Ensembl	ENSG00000043143	ENSMUSG00000020387
UniProt	Q9NQC1	Q6ZQF7
RefSeq (мРНК)	NM_001289984 NM_001289985 NM_001308143 NM_015288 NM_001388185 NM_001388186 NM_001388187 NM_001388188	NM_199299 NM_001357588
RefSeq (білок)	NP_001276913 NP_001276914 NP_001295072 NP_056103 NP_001295072.1	NP_955003 NP_001344517
Локус (UCSC)	Хр. 5: 134.52 – 134.58 Mb	Хр. 11: 51.7 – 51.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

JADE2 (англ. Jade family PHD finger 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 790 амінокислот, а молекулярна маса — 87 466.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEKRRKYSI		SSDNSDTTDS		HATSTSASRC		SKLPSSTKSG		WPRQNEKKPS
EVFRTDLITA		MKIPDSYQLS		PDDYYILADP		WRQEWEKGVQ		VPAGAEAIPE
PVVRILPPLE		GPPAQASPSS		TMLGEGSQPD		WPGGSRYDLD		EIDAYWLELI
NSELKEMERP		ELDELTLERV		LEELETLCHQ		NMARAIETQE		GLGIEYDEDV
VCDVCRSPEG		EDGNEMVFCD		KCNVCVHQAC		YGILKVPTGS		WLCRTCALGV
QPKCLLCPKR		GGALKPTRSG		TKWVHVSCAL		WIPEVSIGCP		EKMEPITKIS
HIPASRWALS		CSLCKECTGT		CIQCSMPSCV		TAFHVTCAFD		HGLEMRTILA
DNDEVKFKSF		CQEHSDGGPR		NEPTSEPTEP		SQAGEDLEKV		TLRKQRLQQL
EEDFYELVEP		AEVAERLDLA		EALVDFIYQY		WKLKRKANAN		QPLLTPKTDE
VDNLAQQEQD		VLYRRLKLFT		HLRQDLERVR		NLCYMVTRRE		RTKHAICKLQ
EQIFHLQMKL		IEQDLCRGLS		TSFPIDGTFF		NSWLAQSVQI		TAENMAMSEW
PLNNGHREDP		APGLLSEELL		QDEETLLSFM		RDPSLRPGDP		ARKARGRTRL
PAKKKPPPPP		PQDGPGSRTT		PDKAPKKTWG		QDAGSGKGGQ		GPPTRKPPRR
TSSHLPSSPA		AGDCPILATP		ESPPPLAPET		PDEAASVAAD		SDVQVPGPAA
SPKPLGRLRP		PRESKVTRRL		PGARPDAGMG		PPSAVAERPK		VSLHFDTETD
GYFSDGEMSD		SDVEAEDGGV		QRGPREAGAE		EVVRMGVLAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tzouanacou E., Tweedie S., Wilson V. (2003). Identification of Jade1, a gene encoding a PHD zinc finger protein, in a gene trap mutagenesis screen for genes involved in anteroposterior axis development. Mol. Cell. Biol. 23: 8553—8562. PMID 14612400 DOI:10.1128/MCB.23.23.8553-8562.2003

Див. також

• Хромосома 5