JAKMIP1

JAKMIP1
Ідентифікатори
Символи	JAKMIP1, Gababrbp, JAMIP1, MARLIN1, janus kinase and microtubule interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611195 MGI: 1923321 HomoloGene: 90789 GeneCards: JAKMIP1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding • RNA binding • GABA receptor binding • mRNA binding • translation regulator activity Клітинна компонента • цитоплазма • microtubule cytoskeleton • мікротрубочка • цитоскелет • мембрана • extrinsic component of membrane • Рибонуклеопротеїни • ribonucleoprotein granule Біологічний процес • protein transport • когнітивність • striatum development • positive regulation of developmental process • positive regulation of cytoplasmic translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	152789	76071
Ensembl	ENSG00000152969	ENSMUSG00000063646
UniProt	Q96N16	Q8BVL9
RefSeq (мРНК)	NM_001099433 NM_001306133 NM_001306134 NM_144720	NM_178394 NM_001347348 NM_001401053 NM_001401054 NM_001401055 NM_001401056
RefSeq (білок)	NP_001092903 NP_001293062 NP_001293063 NP_653321	NP_001334277 NP_848481 NP_001387982 NP_001387983 NP_001387984 NP_001387985
Локус (UCSC)	Хр. 4: 6.03 – 6.2 Mb	Хр. 5: 37.19 – 37.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

JAKMIP1 (англ. Janus kinase and microtubule interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 73 209.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKKGRSKGE		KPEMETDAVQ		MANEELRAKL		TSIQIEFQQE		KSKVGKLRER
LQEAKLEREQ		EQRRHTAYIS		ELKAKLHEEK		TKELQALREG		LIRQHEQEAA
RTAKIKEGEL		QRLQATLNVL		RDGAADKVKT		ALLTEAREEA		RRAFDGERLR
LQQEILELKA		ARKQAEEALS		NCMQADKTKA		ADLRAAYQAH		QDEVHRIKRE
CERDIRRLMD		EIKGKDRVIL		ALEKELGVQA		GQTQKLLLQK		EALDEQLVQV
KEAERHHSSP		KRELPPGIGD		MVELMGVQDQ		HMDERDVRRF		QLKIAELNSV
IRKLEDRNTL		LADERNELLK		RSRETEVQLK		PLVEKNKRMN		KKNEDLLQSI
QRMEEKIKNL		TRENVEMKEK		LSAQASLKRH		TSLNDLSLTR		DEQEIEFLRL
QVLEQQHVID		DLSLERERLL		RSKRHRGKSL		KPPKKHVVET		FFGFDEESVD
SETLSETSYN		TDRTDRTPAT		PEEDLDDATA		REEADLRFCQ		LTREYQALQR
AYALLQEQVG		GTLDAEREAR		TREQLQADLL		RCQAKIEDLE		KLLVEKGQDS
KWVEEKQLLI		RTNQDLLEKI		YRLEMEENQL		KNEMQDAKDQ		NELLEFRVLE
LEVRDSICCK		LSNGADILFE		PKLKFM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4