LARP1

LARP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ZC4, 5C0V
Ідентифікатори
Символи	LARP1, LARP, La ribonucleoprotein domain family member 1, La ribonucleoprotein 1, translational regulator, Lar1, Lhp1
Зовнішні ІД	OMIM: 612059 MGI: 1890165 HomoloGene: 9089 GeneCards: LARP1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA cap binding • translation activator activity • translation initiation factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • eukaryotic initiation factor 4E binding • mRNA 3'-UTR binding • mRNA 5'-UTR binding • RNA binding • cadherin binding • RNA 7-methylguanosine cap binding • ribosomal small subunit binding Клітинна компонента • цитоплазма • TORC1 complex • мембрана • Полісома • cytoplasmic stress granule • polysomal ribosome Біологічний процес • translational initiation • positive regulation of macroautophagy • positive regulation of viral genome replication • проліферація • TOR signaling • Біосинтез білків • positive regulation of translation • negative regulation of translation • TORC1 signaling • mRNA stabilization • cellular response to rapamycin • response to amino acid starvation • regulation of translation • negative regulation of translational initiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23367	73158
Ensembl	ENSG00000155506	ENSMUSG00000037331
UniProt	Q6PKG0	Q6ZQ58
RefSeq (мРНК)	NM_015315 NM_033551 NM_001367713 NM_001367714 NM_001367715 NM_001367716 NM_001367717 NM_001367718 NM_001367719	NM_028451
RefSeq (білок)	NP_056130 NP_001354642 NP_001354643 NP_001354644 NP_001354645 NP_001354646 NP_001354647 NP_001354648 NP_291029	NP_082727
Локус (UCSC)	Хр. 5: 154.68 – 154.82 Mb	Хр. 11: 57.9 – 57.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LARP1 (англ. La ribonucleoprotein domain family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 096 амінокислот, а молекулярна маса — 123 510.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATQVEPLLP		GGATLLQAEE		HGGLVRKKPP		PAPEGKGEPG		PNDVRGGEPD
GSARRPRPPC		AKPHKEGTGQ		QERESPRPLQ		LPGAEGPAIS		DGEEGGGEPG
AGGGAAGAAG		AGRRDFVEAP		PPKVNPWTKN		ALPPVLTTVN		GQSPPEHSAP
AKVVRAAVPK		QRKGSKVGDF		GDAINWPTPG		EIAHKSVQPQ		SHKPQPTRKL
PPKKDMKEQE		KGEGSDSKES		PKTKSDESGE		EKNGDEDCQR		GGQKKKGNKH
KWVPLQIDMK		PEVPREKLAS		RPTRPPEPRH		IPANRGEIKG		SESATYVPVA
PPTPAWQPEI		KPEPAWHDQD		ETSSVKSDGA		GGARASFRGR		GRGRGRGRGR
GRGGTRTHFD		YQFGYRKFDG		VEGPRTPKYM		NNITYYFDNV		SSTELYSVDQ
ELLKDYIKRQ		IEYYFSVDNL		ERDFFLRRKM		DADGFLPITL		IASFHRVQAL
TTDISLIFAA		LKDSKVVEIV		DEKVRRREEP		EKWPLPPIVD		YSQTDFSQLL
NCPEFVPRQH		YQKETESAPG		SPRAVTPVPT		KTEEVSNLKT		LPKGLSASLP
DLDSENWIEV		KKRPRPSPAR		PKKSEESRFS		HLTSLPQQLP		SQQLMSKDQD
EQEELDFLFD		EEMEQMDGRK		NTFTAWSDEE		SDYEIDDRDV		NKILIVTQTP
HYMRRHPGGD		RTGNHTSRAK		MSAELAKVIN		DGLFYYEQDL		WAEKFEPEYS
QIKQEVENFK		KVNMISREQF		DTLTPEPPVD		PNQEVPPGPP		RFQQVPTDAL
ANKLFGAPEP		STIARSLPTT		VPESPNYRNT		RTPRTPRTPQ		LKDSSQTSRF
YPVVKEGRTL		DAKMPRKRKT		RHSSNPPLES		HVGWVMDSRE		HRPRTASISS
SPSEGTPTVG		SYGCTPQSLP		KFQHPSHELL		KENGFTQHVY		HKYRRRCLNE
RKRLGIGQSQ		EMNTLFRFWS		FFLRDHFNKK		MYEEFKQLAL		EDAKEGYRYG
LECLFRYYSY		GLEKKFRLDI		FKDFQEETVK		DYEAGQLYGL		EKFWAFLKYS
KAKNLDIDPK		LQEYLGKFRR		LEDFRVDPPM		GEEGNHKRHS		VVAGGGGGEG
RKRCPSQSSS		RPAAMISQPP		TPPTGQPVRE		DAKWTSQHSN		TQTLGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, біосинтез білка, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 5