LARP4B

LARP4B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3PTH
Ідентифікатори
Символи	LARP4B, KIAA0217, LARP5, La ribonucleoprotein domain family member 4B, La ribonucleoprotein 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 616513 MGI: 106330 HomoloGene: 18195 GeneCards: LARP4B
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • cytoplasmic stress granule • ядерце • мембрана • polysomal ribosome • цитоплазма Біологічний процес • regulation of translation • positive regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23185	217980
Ensembl	ENSG00000107929	ENSMUSG00000033499
UniProt	Q92615	Q6A0A2
RefSeq (мРНК)	NM_015155 NM_001351277	NM_172585 NM_001311117
RefSeq (білок)	NP_055970 NP_001338206	NP_001298046 NP_766173
Локус (UCSC)	Хр. 10: 0.81 – 0.93 Mb	Хр. 13: 9.14 – 9.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LARP4B (англ. La ribonucleoprotein domain family member 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 738 амінокислот, а молекулярна маса — 80 552.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSDQDAKVV		AEPQTQRVQE		GKDSAHLMNG		PISQTTSQTS		SIPPLSQVPA
TKVSELNPNA		EVWGAPVLHL		EASSAADGVS		AAWEEVAGHH		ADRGPQGSDA
NGDGDQGHEN		AALPDPQESD		PADMNALALG		PSEYDSLPEN		SETGGNESQP
DSQEDPREVL		KKTLEFCLSR		ENLASDMYLI		SQMDSDQYVP		ITTVANLDHI
KKLSTDVDLI		VEVLRSLPLV		QVDEKGEKVR		PNQNRCIVIL		REISESTPVE
EVEALFKGDN		LPKFINCEFA		YNDNWFITFE		TEADAQQAYK		YLREEVKTFQ
GKPIKARIKA		KAIAINTFLP		KNGFRPLDVS		LYAQQRYATS		FYFPPMYSPQ
QQFPLYSLIT		PQTWSATHSY		LDPPLVTPFP		NTGFINGFTS		PAFKPAASPL
TSLRQYPPRS		RNPSKSHLRH		AIPSAERGPG		LLESPSIFNF		TADRLINGVR
SPQTRQAGQT		RTRIQNPSAY		AKREAGPGRV		EPGSLESSPG		LGRGRKNSFG
YRKKREEKFT		SSQTQSPTPP		KPPSPSFELG		LSSFPPLPGA		AGNLKTEDLF
ENRLSSLIIG		PSKERTLSAD		ASVNTLPVVV		SREPSVPASC		AVSATYERSP
SPAHLPDDPK		VAEKQRETHS		VDRLPSALTA		TACKSVQVNG		AATELRKPSY
AEICQRTSKE		PPSSPLQPQK		EQKPNTVGCG		KEEKKLAEPA		ERYREPPALK
STPGAPRDQR		RPAGGRPSPS		AMGKRLSREQ		STPPKSPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 10