LCN1

LCN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XKI, 3EYC, 4QAF
Ідентифікатори
Символи	LCN1, PMFA, TLC, TP, VEGP, lipocalin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 151675 HomoloGene: 48099 GeneCards: LCN1
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • zinc ion binding • chloride ion binding • signaling receptor binding • small molecule binding Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір Біологічний процес • retina homeostasis • sensory perception of taste • відповідь на стимул • протеоліз • long-chain fatty acid transport • negative regulation of endopeptidase activity • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3933	65039
Ensembl	ENSG00000160349	ENSRNOG00000033761
UniProt	P31025	P20289
RefSeq (мРНК)	NM_001252617 NM_001252618 NM_001252619 NM_002297	NM_022945
RefSeq (білок)	NP_001239546 NP_001239547 NP_001239548 NP_002288 NP_001239546.1 NP_002288.1	NP_075234
Локус (UCSC)	Хр. 9: 135.52 – 135.53 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LCN1 (англ. Lipocalin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 176 амінокислот, а молекулярна маса — 19 250.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKPLLLAVSL		GLIAALQAHH		LLASDEEIQD		VSGTWYLKAM		TVDREFPEMN
LESVTPMTLT		TLEGGNLEAK		VTMLISGRCQ		EVKAVLEKTD		EPGKYTADGG
KHVAYIIRSH		VKDHYIFYCE		GELHGKPVRG		VKLVGRDPKN		NLEALEDFEK
AAGARGLSTE		SILIPRQSET		CSPGSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як транспорт. Секретований назовні.

Література

• Lassagne H., Gachon A.-M. (1993). Cloning of a human lacrimal lipocalin secreted in tears. Exp. Eye Res. 56: 605—609. PMID 8500570 DOI:10.1006/exer.1993.1075
• Holzfeind P., Redl B. (1994). Structural organization of the gene encoding the human lipocalin tear prealbumin and synthesis of the recombinant protein in Escherichia coli. Gene. 139: 177—183. PMID 8112601 DOI:10.1016/0378-1119(94)90752-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wojnar P., Lechner M., Merschak P., Redl B. (2001). Molecular cloning of a novel lipocalin-1 interacting human cell membrane receptor using phage display. J. Biol. Chem. 276: 20206—20212. PMID 11287427 DOI:10.1074/jbc.M101762200
• Wojnar P., Lechner M., Redl B. (2003). Antisense down-regulation of lipocalin-interacting membrane receptor expression inhibits cellular internalization of lipocalin-1 in human NT2 cells. J. Biol. Chem. 278: 16209—16215. PMID 12591932 DOI:10.1074/jbc.M210922200
• Breustedt D.A., Korndorfer I.P., Redl B., Skerra A. (2005). The 1.8-A crystal structure of human tear lipocalin reveals an extended branched cavity with capacity for multiple ligands. J. Biol. Chem. 280: 484—493. PMID 15489503 DOI:10.1074/jbc.M410466200

Див. також

• Хромосома 9