LETM1

LETM1
Ідентифікатори
Символи	LETM1, leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1, SLC55A1
Зовнішні ІД	OMIM: 604407 MGI: 1932557 HomoloGene: 56320 GeneCards: LETM1
Онтологія гена Молекулярна функція • ribosome binding • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • calcium:proton antiporter activity • antiporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мітохондріальна внутрішня мембрана • мембрана • мітохондрія Біологічний процес • cristae formation • cellular metal ion homeostasis • mitochondrial calcium ion transmembrane transport • protein hexamerization • protein homooligomerization • mitochondrial calcium ion homeostasis • calcium export from the mitochondrion • ion transport • calcium ion transport • negative regulation of mitochondrial calcium ion concentration • regulation of cellular hyperosmotic salinity response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3954	56384
Ensembl	ENSG00000168924	ENSMUSG00000005299
UniProt	O95202	Q9Z2I0
RefSeq (мРНК)	NM_012318	NM_019694
RefSeq (білок)	NP_036450	NP_062668
Локус (UCSC)	Хр. 4: 1.81 – 1.86 Mb	Хр. 5: 33.9 – 33.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LETM1 (англ. Leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 83 354.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASILLRSCR		GRAPARLPPP		PRYTVPRGSP		GDPAHLSCAS		TLGLRNCLNV
PFGCCTPIHP		VYTSSRGDHL		GCWALRPECL		RIVSRAPWTS		TSVGFVAVGP
QCLPVRGWHS		SRPVRDDSVV		EKSLKSLKDK		NKKLEEGGPV		YSPPAEVVVK
KSLGQRVLDE		LKHYYHGFRL		LWIDTKIAAR		MLWRILNGHS		LTRRERRQFL
RICADLFRLV		PFLVFVVVPF		MEFLLPVAVK		LFPNMLPSTF		ETQSLKEERL
KKELRVKLEL		AKFLQDTIEE		MALKNKAAKG		SATKDFSVFF		QKIRETGERP
SNEEIMRFSK		LFEDELTLDN		LTRPQLVALC		KLLELQSIGT		NNFLRFQLTM
RLRSIKADDK		LIAEEGVDSL		NVKELQAACR		ARGMRALGVT		EDRLRGQLKQ
WLDLHLHQEI		PTSLLILSRA		MYLPDTLSPA		DQLKSTLQTL		PEIVAKEAQV
KVAEVEGEQV		DNKAKLEATL		QEEAAIQQEH		REKELQKRSE		VAKDFEPERV
VAAPQRPGTE		PQPEMPDTVL		QSETLKDTAP		VLEGLKEEEI		TKEEIDILSD
ACSKLQEQKK		SLTKEKEELE		LLKEDVQDYS		EDLQEIKKEL		SKTGEEKYVE
ESKASKRLTK		RVQQMIGQID		GLISQLEMDQ		QAGKLAPANG		MPTGENVISV
AELINAMKQV		KHIPESKLTS		LAAALDENKD		GKVNIDDLVK		VIELVDKEDV
HISTSQVAEI		VATLEKEEKV		EEKEKAKEKA		EKEVAEVKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

• Endele S., Fuhry M., Pak S.-J., Zabel B.U., Winterpacht A. (1999). LETM1, a novel gene encoding a putative EF-hand Ca(2+)-binding protein, flanks the Wolf-Hirschhorn syndrome (WHS) critical region and is deleted in most WHS patients. Genomics. 60: 218—225. PMID 10486213 DOI:10.1006/geno.1999.5881
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jiang D., Zhao L., Clapham D.E. (2009). Genome-wide RNAi screen identifies Letm1 as a mitochondrial Ca2+/H+ antiporter. Science. 326: 144—147. PMID 19797662 DOI:10.1126/science.1175145

Див. також

• Хромосома 4