LINGO1

LINGO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ID5, 4OQT
Ідентифікатори
Символи	LINGO1, LERN1, LRRN6A, UNQ201, leucine rich repeat and Ig domain containing 1, MRT64
Зовнішні ІД	OMIM: 609791 MGI: 1915522 HomoloGene: 41891 GeneCards: LINGO1
Пов'язані генетичні захворювання
essential tremor
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • epidermal growth factor receptor binding Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • negative regulation of axonogenesis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • аксоноґенеза Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84894	235402
Ensembl	ENSG00000169783	ENSMUSG00000049556
UniProt	Q96FE5	Q9D1T0
RefSeq (мРНК)	NM_001301186 NM_001301187 NM_001301189 NM_001301191 NM_001301192 NM_001301194 NM_001301195 NM_001301197 NM_001301198 NM_001301199 NM_001301200 NM_032808	NM_181074 NM_001311076 NM_001361115 NM_001361116 NM_001361117 NM_001361118 NM_001361119 NM_001361120
RefSeq (білок)	NP_001288115 NP_001288116 NP_001288118 NP_001288120 NP_001288121 NP_001288123 NP_001288124 NP_001288126 NP_001288127 NP_001288128 NP_001288129 NP_116197	NP_001298005 NP_851419 NP_001348044 NP_001348045 NP_001348046 NP_001348047 NP_001348048 NP_001348049
Локус (UCSC)	Хр. 15: 77.61 – 77.82 Mb	Хр. 9: 56.53 – 56.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LINGO1 (англ. Leucine rich repeat and Ig domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 620 амінокислот, а молекулярна маса — 69 876.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQVSKRMLAG		GVRSMPSPLL		ACWQPILLLV		LGSVLSGSAT		GCPPRCECSA
QDRAVLCHRK		RFVAVPEGIP		TETRLLDLGK		NRIKTLNQDE		FASFPHLEEL
ELNENIVSAV		EPGAFNNLFN		LRTLGLRSNR		LKLIPLGVFT		GLSNLTKLDI
SENKIVILLD		YMFQDLYNLK		SLEVGDNDLV		YISHRAFSGL		NSLEQLTLEK
CNLTSIPTEA		LSHLHGLIVL		RLRHLNINAI		RDYSFKRLYR		LKVLEISHWP
YLDTMTPNCL		YGLNLTSLSI		THCNLTAVPY		LAVRHLVYLR		FLNLSYNPIS
TIEGSMLHEL		LRLQEIQLVG		GQLAVVEPYA		FRGLNYLRVL		NVSGNQLTTL
EESVFHSVGN		LETLILDSNP		LACDCRLLWV		FRRRWRLNFN		RQQPTCATPE
FVQGKEFKDF		PDVLLPNYFT		CRRARIRDRK		AQQVFVDEGH		TVQFVCRADG
DPPPAILWLS		PRKHLVSAKS		NGRLTVFPDG		TLEVRYAQVQ		DNGTYLCIAA
NAGGNDSMPA		HLHVRSYSPD		WPHQPNKTFA		FISNQPGEGE		ANSTRATVPF
PFDIKTLIIA		TTMGFISFLG		VVLFCLVLLF		LWSRGKGNTK		HNIEIEYVPR
KSDAGISSAD		APRKFNMKMI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Carim-Todd L., Escarceller M., Estivill X., Sumoy L. (2003). LRRN6A/LERN1 (leucine-rich repeat neuronal protein 1), a novel gene with enriched expression in limbic system and neocortex. Eur. J. Neurosci. 18: 3167—3182. PMID 14686891 DOI:10.1111/j.1460-9568.2003.03003.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15