LRCH1

LRCH1
Ідентифікатори
Символи	LRCH1, CHDC1, NP81, leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 1, leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610368 MGI: 2443390 HomoloGene: 32244 GeneCards: LRCH1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • цитоплазма Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • cellular response to chemokine • negative regulation of T cell migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23143	380916
Ensembl	ENSG00000136141	ENSMUSG00000068015
UniProt	Q9Y2L9	P62046
RefSeq (мРНК)	NM_001164211 NM_001164213 NM_015116	NM_001033439 NM_001252132
RefSeq (білок)	NP_001157683 NP_001157685 NP_055931	NP_001028611 NP_001239061
Локус (UCSC)	Хр. 13: 46.55 – 46.75 Mb	Хр. 14: 74.99 – 75.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRCH1 (англ. Leucine rich repeats and calponin homology domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 728 амінокислот, а молекулярна маса — 80 875.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATPGSEPQP		FVPALSVATL		HPLHHPHHHH		HHHQHHGGTG		APGGAGGGGG
GSGGFNLPLN		RGLERALEEA		ANSGGLNLSA		RKLKEFPRTA		APGHDLSDTV
QADLSKNRLV		EVPMELCHFV		SLEILNLYHN		CIRVIPEAIV		NLQMLTYLNL
SRNQLSALPA		CLCGLPLKVL		IASNNKLGSL		PEEIGQLKQL		MELDVSCNEI
TALPQQIGQL		KSLRELNVRR		NYLKVLPQEL		VDLSLVKFDF		SCNKVLVIPI
CFREMKQLQV		LLLENNPLQS		PPAQICTKGK		VHIFKYLSIQ		ACQIKTADSL
YLHTMERPHL		HQHVEDGKKD		SDSGVGSDNG		DKRLSATEPS		DEDTVSLNVP
MSNIMEEEQI		IKEDSCHRLS		PVKGEFHQEF		QPEPSLLGDS		TNSGEERDQF
TDRADGLHSE		FMNYKARAED		CEELLRIEED		VHWQTEGIIS		SSKDQDMDIA
MIEQLREAVD		LLQDPNGLST		DITERSVLNL		YPMGSAEALE		LQDSALNGQI
QLETSPVCEV		QSDLTLQSNG		SQYSPNEIRE		NSPAVSPTTN		STAPFGLKPR
SVFLRPQRNL		ESIDPQFTIR		RKMEQMREEK		ELVEQLRESI		EMRLKVSLHE
DLGAALMDGV		VLCHLVNHIR		PRSVASIHVP		SPAVPKLSMA		KCRRNVENFL
EACRKLGVPE		ADLCSPCDIL		QLDFRHIRKT		VDTLLALGEK		APPPTSALRS
RDLIGFCLVH		ILFIVLVYIT		YHWNALSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13