LRFN1

LRFN1
Ідентифікатори
Символи	LRFN1, SALM2, leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 612807 MGI: 2136810 HomoloGene: 12729 GeneCards: LRFN1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57622	80749
Ensembl	ENSG00000128011	ENSMUSG00000030600
UniProt	Q9P244	Q2WF71
RefSeq (мРНК)	NM_020862	NM_001141921 NM_030562
RefSeq (білок)	NP_065913	NP_001135393 NP_085039
Локус (UCSC)	Хр. 19: 39.31 – 39.32 Mb	Хр. 7: 28.15 – 28.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRFN1 (англ. Leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 771 амінокислот, а молекулярна маса — 82 318.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPGPFSSAL		LSPPPAALPF		LLLLWAGASR		GQPCPGRCIC		QNVAPTLTML
CAKTGLLFVP		PAIDRRVVEL		RLTDNFIAAV		RRRDFANMTS		LVHLTLSRNT
IGQVAAGAFA		DLRALRALHL		DSNRLAEVRG		DQLRGLGNLR		HLILGNNQIR
RVESAAFDAF		LSTVEDLDLS		YNNLEALPWE		AVGQMVNLNT		LTLDHNLIDH
IAEGTFVQLH		KLVRLDMTSN		RLHKLPPDGL		FLRSQGTGPK		PPTPLTVSFG
GNPLHCNCEL		LWLRRLTRED		DLETCATPEH		LTDRYFWSIP		EEEFLCEPPL
ITRQAGGRAL		VVEGQAVSLR		CRAVGDPEPV		VHWVAPDGRL		LGNSSRTRVR
GDGTLDVTIT		TLRDSGTFTC		IASNAAGEAT		APVEVCVVPL		PLMAPPPAAP
PPLTEPGSSD		IATPGRPGAN		DSAAERRLVA		AELTSNSVLI		RWPAQRPVPG
IRMYQVQYNS		SVDDSLVYRM		IPSTSQTFLV		NDLAAGRAYD		LCVLAVYDDG
ATALPATRVV		GCVQFTTAGD		PAPCRPLRAH		FLGGTMIIAI		GGVIVASVLV
FIVLLMIRYK		VYGDGDSRRV		KGSRSLPRVS		HVCSQTNGAG		TGAAQAPALP
AQDHYEALRE		VESQAAPAVA		VEAKAMEAET		ASAEPEVVLG		RSLGGSATSL
CLLPSEETSG		EESRAAVGPR		RSRSGALEPP		TSAPPTLALV		PGGAAARPRP
QQRYSFDGDY		GALFQSHSYP		RRARRTKRHR		STPHLDGAGG		GAAGEDGDLG
LGSARACLAF		TSTEWMLEST		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19