LRRC38

LRRC38
Ідентифікатори
Символи	LRRC38, leucine rich repeat containing 38
Зовнішні ІД	OMIM: 615212 MGI: 2442845 HomoloGene: 77949 GeneCards: LRRC38
Онтологія гена Молекулярна функція • voltage-gated potassium channel activity • transmembrane transporter binding • potassium channel activator activity Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane • voltage-gated potassium channel complex Біологічний процес • ion transport • аксоноґенеза • potassium ion transmembrane transport • positive regulation of voltage-gated potassium channel activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	126755	242735
Ensembl	ENSG00000162494	ENSMUSG00000028584
UniProt	Q5VT99	A2VDH3
RefSeq (мРНК)	NM_001010847	NM_001162983
RefSeq (білок)	NP_001010847	NP_001156455
Локус (UCSC)	Хр. 1: 13.47 – 13.51 Mb	Хр. 4: 143.08 – 143.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRRC38 (англ. Leucine rich repeat containing 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 294 амінокислот, а молекулярна маса — 32 082.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRPRAPACAA		AALGLCSLLL		LLAPGHACPA		GCACTDPHTV		DCRDRGLPSV
PDPFPLDVRK		LLVAGNRIQR		IPEDFFIFYG		DLVYLDFRNN		SLRSLEEGTF
SGSAKLVFLD		LSYNNLTQLG		AGAFRSAGRL		VKLSLANNNL		VGVHEDAFET
LESLQVLELN		DNNLRSLSVA		ALAALPALRS		LRLDGNPWLC		DCDFAHLFSW
IQENASKLPK		GLDEIQCSLP		MESRRISLRE		LSEASFSECR		FSLSLTDLCI
IIFSGVAVSI		AAIISSFFLA		TVVQCLQRCA		PNKDAEDEDE		DKDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yan J., Aldrich R.W. (2012). BK potassium channel modulation by leucine-rich repeat-containing proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 7917—7922. PMID 22547800 DOI:10.1073/pnas.1205435109

Див. також

• Хромосома 1