LRRC4C

LRRC4C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZYJ
Ідентифікатори
Символи	LRRC4C, NGL-1, NGL1, leucine rich repeat containing 4C
Зовнішні ІД	OMIM: 608817 MGI: 2442636 HomoloGene: 18696 GeneCards: LRRC4C
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cell adhesion molecule binding • cell-cell adhesion mediator activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • міжклітинні контакти • postsynaptic membrane • клітинна мембрана • синапс • мембрана • міжклітинний простір • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic density membrane Біологічний процес • regulation of axonogenesis • negative regulation of protein kinase activity • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • modulation of chemical synaptic transmission • synaptic membrane adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57689	241568
Ensembl	ENSG00000148948	ENSMUSG00000050587
UniProt	Q9HCJ2	Q8C031
RefSeq (мРНК)	NM_001258419 NM_020929	NM_001289742 NM_001289743 NM_001289744 NM_178725 NM_001363047 NM_001363048 NM_001363049
RefSeq (білок)	NP_001245348 NP_065980	NP_001276671 NP_001276672 NP_001276673 NP_848840 NP_001349976 NP_001349977 NP_001349978
Локус (UCSC)	Хр. 11: 40.11 – 41.46 Mb	Хр. 2: 96.15 – 97.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRRC4C (англ. Leucine rich repeat containing 4C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 640 амінокислот, а молекулярна маса — 71 950.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLNKMTLHPQ		QIMIGPRFNR		ALFDPLLVVL		LALQLLVVAG		LVRAQTCPSV
CSCSNQFSKV		ICVRKNLREV		PDGISTNTRL		LNLHENQIQI		IKVNSFKHLR
HLEILQLSRN		HIRTIEIGAF		NGLANLNTLE		LFDNRLTTIP		NGAFVYLSKL
KELWLRNNPI		ESIPSYAFNR		IPSLRRLDLG		ELKRLSYISE		GAFEGLSNLR
YLNLAMCNLR		EIPNLTPLIK		LDELDLSGNH		LSAIRPGSFQ		GLMHLQKLWM
IQSQIQVIER		NAFDNLQSLV		EINLAHNNLT		LLPHDLFTPL		HHLERIHLHH
NPWNCNCDIL		WLSWWIKDMA		PSNTACCARC		NTPPNLKGRY		IGELDQNYFT
CYAPVIVEPP		ADLNVTEGMA		AELKCRASTS		LTSVSWITPN		GTVMTHGAYK
VRIAVLSDGT		LNFTNVTVQD		TGMYTCMVSN		SVGNTTASAT		LNVTAATTTP
FSYFSTVTVE		TMEPSQDEAR		TTDNNVGPTP		VVDWETTNVT		TSLTPQSTRS
TEKTFTIPVT		DINSGIPGID		EVMKTTKIII		GCFVAITLMA		AVMLVIFYKM
RKQHHRQNHH		APTRTVEIIN		VDDEITGDTP		MESHLPMPAI		EHEHLNHYNS
YKSPFNHTTT		VNTINSIHSS		VHEPLLIRMN		SKDNVQETQI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lin J.C., Ho W.-H., Gurney A.L., Rosenthal A. (2003). The netrin-G1 ligand NGL-1 promotes the outgrowth of thalamocortical axons. Nat. Neurosci. 6: 1270—1276. PMID 14595443 DOI:10.1038/nn1148

Див. також

• Хромосома 11