LSM1

LSM1
Ідентифікатори
Символи	LSM1, CASM, YJL124C, LSM1 homolog, mRNA degradation associated
Зовнішні ІД	OMIM: 607281 MGI: 1914457 HomoloGene: 40945 GeneCards: LSM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA cap binding • pre-mRNA binding • mRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • P-body • messenger ribonucleoprotein complex • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • клітинне ядро • цитоплазма • mRNA cap binding complex • Lsm1-7-Pat1 complex Біологічний процес • negative regulation of neuron differentiation • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA processing • stem cell population maintenance • Сплайсинг РНК • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • histone mRNA catabolic process • nuclear-transcribed mRNA catabolic process • RNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27257	67207
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000037296
UniProt	O15116	Q8VC85
RefSeq (мРНК)	NM_014462	NM_026032
RefSeq (білок)	NP_055277	NP_080308
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 8: 26.28 – 26.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LSM1 (англ. LSM1 homolog, mRNA degradation associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 133 амінокислот, а молекулярна маса — 15 179.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNYMPGTASL		IEDIDKKHLV		LLRDGRTLIG		FLRSIDQFAN		LVLHQTVERI
HVGKKYGDIP		RGIFVVRGEN		VVLLGEIDLE		KESDTPLQQV		SIEEILEEQR
VEQQTKLEAE		KLKVQALKDR		GLSIPRADTL		DEY

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Salgado-Garrido J., Bragado-Nilsson E., Kandels-Lewis S., Seraphin B. (1999). Sm and Sm-like proteins assemble in two related complexes of deep evolutionary origin. EMBO J. 18: 3451—3462. PMID 10369684 DOI:10.1093/emboj/18.12.3451
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708

Див. також

• Хромосома 8