LTB

LTB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4MXW
Ідентифікатори
Символи	LTB, TNFC, TNFSF3, p33, Lymphotoxin beta, TNLG1C
Зовнішні ІД	OMIM: 600978 MGI: 104796 HomoloGene: 1752 GeneCards: LTB
Онтологія гена Молекулярна функція • tumor necrosis factor receptor binding • cytokine activity • signaling receptor binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • міжклітинний простір • компонент клітини Біологічний процес • cell-cell signaling • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • lymph node development • експресія генів • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • skin development • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4050	16994
Ensembl	ENSG00000223448 ENSG00000238114 ENSG00000236925 ENSG00000231314 ENSG00000204487 ENSG00000236237 ENSG00000227507 ENSG00000206437	ENSMUSG00000024399
UniProt	Q06643	P41155
RefSeq (мРНК)	NM_009588 NM_002341	NM_008518
RefSeq (білок)	NP_002332 NP_033666	NP_032544
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.58 – 31.58 Mb	Хр. 17: 35.41 – 35.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LTB (англ. Lymphotoxin beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 244 амінокислот, а молекулярна маса — 25 390.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGALGLEGRG		GRLQGRGSLL		LAVAGATSLV		TLLLAVPITV		LAVLALVPQD
QGGLVTETAD		PGAQAQQGLG		FQKLPEEEPE		TDLSPGLPAA		HLIGAPLKGQ
GLGWETTKEQ		AFLTSGTQFS		DAEGLALPQD		GLYYLYCLVG		YRGRAPPGGG
DPQGRSVTLR		SSLYRAGGAY		GPGTPELLLE		GAETVTPVLD		PARRQGYGPL
WYTSVGFGGL		VQLRRGERVY		VNISHPDMVD		FARGKTFFGA		VMVG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Neville M.J., Campbell R.D. (1999). A new member of the Ig superfamily and a V-ATPase G subunit are among the predicted products of novel genes close to the TNF locus in the human MHC. J. Immunol. 162: 4745—4754. PMID 10202016

Див. також

• Хромосома 6