LTBP1

LTBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KSQ
Ідентифікатори
Символи	LTBP1, latent transforming growth factor beta binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 150390 MGI: 109151 HomoloGene: 522 GeneCards: LTBP1
Пов'язані генетичні захворювання
натуральна віспа
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • transforming growth factor beta-activated receptor activity • growth factor binding • microfibril binding • transforming growth factor beta binding • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • microfibril • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region • GO:0009327 protein-containing complex • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • ventricular septum development • sequestering of TGFbeta in extracellular matrix • coronary vasculature development • aorta development • transmembrane receptor protein serine/threonine kinase signaling pathway • посттрансляційна модифікація • regulation of transforming growth factor beta activation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4052	268977
Ensembl	ENSG00000049323	ENSMUSG00000001870
UniProt	Q14766	Q8CG19
RefSeq (мРНК)	NM_000627 NM_001166264 NM_001166265 NM_001166266 NM_206943	NM_019919 NM_206958 NM_001331233 NM_001331234 NM_001331235 NM_001331236 NM_001331237
RefSeq (білок)	NP_000618 NP_001159736 NP_001159737 NP_001159738 NP_996826	NP_001318162 NP_001318163 NP_001318164 NP_001318165 NP_001318166 NP_064303 NP_996841
Локус (UCSC)	Хр. 2: 32.95 – 33.4 Mb	Хр. 17: 75.31 – 75.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LTBP1 (англ. Latent transforming growth factor beta binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 721 амінокислот, а молекулярна маса — 186 796.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGAWLRWGL		LLWAGLLASS		AHGRLRRITY		VVHPGPGLAA		GALPLSGPPR
SRTFNVALNA		RYSRSSAAAG		APSRASPGVP		SERTRRTSKP		GGAALQGLRP
PPPPPPEPAR		PAVPGGQLHP		NPGGHPAAAP		FTKQGRQVVR		SKVPQETQSG
GGSRLQVHQK		QQLQGVNVCG		GRCCHGWSKA		PGSQRCTKPS		CVPPCQNGGM
CLRPQLCVCK		PGTKGKACET		IAAQDTSSPV		FGGQSPGAAS		SWGPPEQAAK
HTSSKKADTL		PRVSPVAQMT		LTLKPKPSVG		LPQQIHSQVT		PLSSQSVVIH
HGQTQEYVLK		PKYFPAQKGI		SGEQSTEGSF		PLRYVQDQVA		APFQLSNHTG
RIKVVFTPSI		CKVTCTKGSC		QNSCEKGNTT		TLISENGHAA		DTLTATNFRV
VICHLPCMNG		GQCSSRDKCQ		CPPNFTGKLC		QIPVHGASVP		KLYQHSQQPG
KALGTHVIHS		THTLPLTVTS		QQGVKVKFPP		NIVNIHVKHP		PEASVQIHQV
SRIDGPTGQK		TKEAQPGQSQ		VSYQGLPVQK		TQTIHSTYSH		QQVIPHVYPV
AAKTQLGRCF		QETIGSQCGK		ALPGLSKQED		CCGTVGTSWG		FNKCQKCPKK
PSYHGYNQMM		ECLPGYKRVN		NTFCQDINEC		QLQGVCPNGE		CLNTMGSYRC
TCKIGFGPDP		TFSSCVPDPP		VISEEKGPCY		RLVSSGRQCM		HPLSVHLTKQ
LCCCSVGKAW		GPHCEKCPLP		GTAAFKEICP		GGMGYTVSGV		HRRRPIHHHV
GKGPVFVKPK		NTQPVAKSTH		PPPLPAKEEP		VEALTFSREH		GPGVAEPEVA
TAPPEKEIPS		LDQEKTKLEP		GQPQLSPGIS		TIHLHPQFPV		VIEKTSPPVP
VEVAPEASTS		SASQVIAPTQ		VTEINECTVN		PDICGAGHCI		NLPVRYTCIC
YEGYRFSEQQ		RKCVDIDECT		QVQHLCSQGR		CENTEGSFLC		ICPAGFMASE
EGTNCIDVDE		CLRPDVCGEG		HCVNTVGAFR		CEYCDSGYRM		TQRGRCEDID
ECLNPSTCPD		EQCVNSPGSY		QCVPCTEGFR		GWNGQCLDVD		ECLEPNVCAN
GDCSNLEGSY		MCSCHKGYTR		TPDHKHCRDI		DECQQGNLCV		NGQCKNTEGS
FRCTCGQGYQ		LSAAKDQCED		IDECQHRHLC		AHGQCRNTEG		SFQCVCDQGY
RASGLGDHCE		DINECLEDKS		VCQRGDCINT		AGSYDCTCPD		GFQLDDNKTC
QDINECEHPG		LCGPQGECLN		TEGSFHCVCQ		QGFSISADGR		TCEDIDECVN
NTVCDSHGFC		DNTAGSFRCL		CYQGFQAPQD		GQGCVDVNEC		ELLSGVCGEA
FCENVEGSFL		CVCADENQEY		SPMTGQCRSR		TSTDLDVDVD		QPKEEKKECY
YNLNDASLCD		NVLAPNVTKQ		ECCCTSGVGW		GDNCEIFPCP		VLGTAEFTEM
CPKGKGFVPA		GESSSEAGGE		NYKDADECLL		FGQEICKNGF		CLNTRPGYEC
YCKQGTYYDP		VKLQCFDMDE		CQDPSSCIDG		QCVNTEGSYN		CFCTHPMVLD
ASEKRCIRPA		ESNEQIEETD		VYQDLCWEHL		SDEYVCSRPL		VGKQTTYTEC
CCLYGEAWGM		QCALCPLKDS		DDYAQLCNIP		VTGRRQPYGR		DALVDFSEQY
TPEADPYFIQ		DRFLNSFEEL		QAEECGILNG		CENGRCVRVQ		EGYTCDCFDG
YHLDTAKMTC		VDVNECDELN		NRMSLCKNAK		CINTDGSYKC		LCLPGYVPSD
KPNYCTPLNT		ALNLEKDSDL		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Saharinen J., Hyytiainen M., Taipale J., Keski-Oja J. (1999). Latent transforming growth factor-beta binding proteins (LTBPs) --structural extracellular matrix proteins for targeting TGF-beta action. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 99—117. PMID 10743502 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00010-6
• Oklu R., Hesketh R. (2000). The latent transforming growth factor beta binding protein (LTBP) family. Biochem. J. 352: 601—610. PMID 11104663 DOI:10.1042/bj3520601
• Saharinen J., Keski-Oja J. (2000). Specific sequence motif of 8-Cys repeats of TGF-beta binding proteins, LTBPs, creates a hydrophobic interaction surface for binding of small latent TGF-beta. Mol. Biol. Cell. 11: 2691—2704. PMID 10930463 DOI:10.1091/mbc.11.8.2691
• Hirani R., Hanssen E., Gibson M.A. (2007). LTBP-2 specifically interacts with the amino-terminal region of fibrillin-1 and competes with LTBP-1 for binding to this microfibrillar protein. Matrix Biol. 26: 213—223. PMID 17293099 DOI:10.1016/j.matbio.2006.12.006

Див. також

• Хромосома 2