MAP1LC3C

MAP1LC3C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3VVW, 3WAM, 3WAP
Ідентифікатори
Символи	MAP1LC3C, ATG8J, LC3C, microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 609605 HomoloGene: 59161 GeneCards: MAP1LC3C
Онтологія гена Молекулярна функція • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • microtubule binding Клітинна компонента • система ендомембран • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • цитоплазма • organelle membrane • мікротрубочка • цитоскелет • autophagosome membrane • гіалоплазма • autophagosome • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • автофагія • autophagosome assembly • autophagy of mitochondrion • cellular response to nitrogen starvation • cellular response to starvation • macroautophagy • GO:0000046 autophagosome maturation • aggrephagy Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	440738	393268
Ensembl	ENSG00000197769	ENSDARG00000100528
UniProt	Q9BXW4	Q7ZWC0
RefSeq (мРНК)	NM_001004343	NM_200298
RefSeq (білок)	NP_001004343	NP_956592
Локус (UCSC)	Хр. 1: 242 – 242 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MAP1LC3C (англ. Microtubule associated protein 1 light chain 3 gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 147 амінокислот, а молекулярна маса — 16 852.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPPPQKIPSV		RPFKQRKSLA		IRQEEVAGIR		AKFPNKIPVV		VERYPRETFL
PPLDKTKFLV		PQELTMTQFL		SIIRSRMVLR		ATEAFYLLVN		NKSLVSMSAT
MAEIYRDYKD		EDGFVYMTYA		SQETFGCLES		AAPRDGSSLE		DRPCNPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, автофагія. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Behrends C., Sowa M.E., Gygi S.P., Harper J.W. (2010). Network organization of the human autophagy system. Nature. 466: 68—76. PMID 20562859 DOI:10.1038/nature09204
• Lee D.Y., Arnott D., Brown E.J. (2013). Ubiquilin4 is an adaptor protein that recruits Ubiquilin1 to the autophagy machinery. EMBO Rep. 14: 373—381. PMID 23459205 DOI:10.1038/embor.2013.22

Див. також

• Хромосома 1