MARCH6

MARCH6
Ідентифікатори
Символи	MARCHF6, DOA10, MARCH-VI, RNF176, TEB4, membrane associated ring-CH-type finger 6, MARCH6, FAME3
Зовнішні ІД	OMIM: 613297 MGI: 2442773 HomoloGene: 4301 GeneCards: MARCHF6
Онтологія гена Молекулярна функція • enzyme binding • ubiquitin-specific protease binding • zinc ion binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of endoplasmic reticulum membrane • ER ubiquitin ligase complex • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum quality control compartment Біологічний процес • protein K48-linked ubiquitination • proteasomal protein catabolic process • ERAD pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • endoplasmic reticulum mannose trimming • ubiquitin-dependent ERAD pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10299	223455
Ensembl	ENSG00000145495	ENSMUSG00000039100
UniProt	O60337	Q6ZQ89
RefSeq (мРНК)	NM_001270660 NM_001270661 NM_005885	NM_172606
RefSeq (білок)	NP_001257589 NP_001257590 NP_005876	NP_766194 NP_001389808
Локус (UCSC)	Хр. 5: 10.35 – 10.44 Mb	Хр. 15: 31.46 – 31.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MARCH6 (англ. Membrane associated ring-CH-type finger 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 910 амінокислот, а молекулярна маса — 102 545.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDTAEEDICR		VCRSEGTPEK		PLYHPCVCTG		SIKFIHQECL		VQWLKHSRKE
YCELCKHRFA		FTPIYSPDMP		SRLPIQDIFA		GLVTSIGTAI		RYWFHYTLVA
FAWLGVVPLT		ACRIYKCLFT		GSVSSLLTLP		LDMLSTENLL		ADCLQGCFVV
TCTLCAFISL		VWLREQIVHG		GAPIWLEHAA		PPFNAAGHHQ		NEAPAGGNGA
ENVAADQPAN		PPAENAVVGE		NPDAQDDQAE		EEEEDNEEED		DAGVEDAADA
NNGAQDDMNW		NALEWDRAAE		ELTWERMLGL		DGSLVFLEHV		FWVVSLNTLF
ILVFAFCPYH		IGHFSLVGLG		FEEHVQASHF		EGLITTIVGY		ILLAITLIIC
HGLATLVKFH		RSRRLLGVCY		IVVKVSLLVV		VEIGVFPLIC		GWWLDICSLE
MFDATLKDRE		LSFQSAPGTT		MFLHWLVGMV		YVFYFASFIL		LLREVLRPGV
LWFLRNLNDP		DFNPVQEMIH		LPIYRHLRRF		ILSVIVFGSI		VLLMLWLPIR
IIKSVLPNFL		PYNVMLYSDA		PVSELSLELL		LLQVVLPALL		EQGHTRQWLK
GLVRAWTVTA		GYLLDLHSYL		LGDQEENENS		ANQQVNNNQH		ARNNNAIPVV
GEGLHAAHQA		ILQQGGPVGF		QPYRRPLNFP		LRIFLLIVFM		CITLLIASLI
CLTLPVFAGR		WLMSFWTGTA		KIHELYTAAC		GLYVCWLTIR		AVTVMVAWMP
QGRRVIFQKV		KEWSLMIMKT		LIVAVLLAGV		VPLLLGLLFE		LVIVAPLRVP
LDQTPLFYPW		QDWALGVLHA		KIIAAITLMG		PQWWLKTVIE		QVYANGIRNI
DLHYIVRKLA		APVISVLLLS		LCVPYVIASG		VVPLLGVTAE		MQNLVHRRIY
PFLLMVVVLM		AILSFQVRQF		KRLYEHIKND		KYLVGQRLVN		YERKSGKQGS
SPPPPQSSQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Swanson R., Locher M., Hochstrasser M. (2001). A conserved ubiquitin ligase of the nuclear envelope/endoplasmic reticulum that functions in both ER-associated and Matalpha2 repressor degradation. Genes Dev. 15: 2660—2674. PMID 11641273 DOI:10.1101/gad.933301
• Kreft S.G., Wang L., Hochstrasser M. (2006). Membrane topology of the yeast endoplasmic reticulum-localized ubiquitin ligase Doa10 and comparison with its human ortholog TEB4 (MARCH-VI). J. Biol. Chem. 281: 4646—4653. PMID 16373356 DOI:10.1074/jbc.M512215200

Див. також

• Хромосома 5