MATN1

MATN1
Ідентифікатори
Символи	MATN1, CMP, CRTM, matrilin 1, cartilage matrix protein, matrilin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 115437 MGI: 106591 HomoloGene: 1783 GeneCards: MATN1
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding Клітинна компонента • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix • міжклітинний простір Біологічний процес • extracellular matrix organization • chondrocyte differentiation • growth plate cartilage chondrocyte morphogenesis • regulation of bone mineralization • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4146	17180
Ensembl	ENSG00000162510	ENSMUSG00000040533
UniProt	P21941	P51942
RefSeq (мРНК)	NM_002379	NM_010769
RefSeq (білок)	NP_002370	NP_034899
Локус (UCSC)	Хр. 1: 30.71 – 30.72 Mb	Хр. 4: 130.67 – 130.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MATN1 (англ. Matrilin 1, cartilage matrix protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 496 амінокислот, а молекулярна маса — 53 701.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRVLSGTSLM		LCSLLLLLQA		LCSPGLAPQS		RGHLCRTRPT		DLVFVVDSSR
SVRPVEFEKV		KVFLSQVIES		LDVGPNATRV		GMVNYASTVK		QEFSLRAHVS
KAALLQAVRR		IQPLSTGTMT		GLAIQFAITK		AFGDAEGGRS		RSPDISKVVI
VVTDGRPQDS		VQDVSARARA		SGVELFAIGV		GSVDKATLRQ		IASEPQDEHV
DYVESYSVIE		KLSRKFQEAF		CVVSDLCATG		DHDCEQVCIS		SPGSYTCACH
EGFTLNSDGK		TCNVCSGGGG		SSATDLVFLI		DGSKSVRPEN		FELVKKFISQ
IVDTLDVSDK		LAQVGLVQYS		SSVRQEFPLG		RFHTKKDIKA		AVRNMSYMEK
GTMTGAALKY		LIDNSFTVSS		GARPGAQKVG		IVFTDGRSQD		YINDAAKKAK
DLGFKMFAVG		VGNAVEDELR		EIASEPVAEH		YFYTADFKTI		NQIGKKLQKK
ICVEEDPCAC		ESLVKFQAKV		EGLLQALTRK		LEAVSKRLAI		LENTVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Mann H.H., Oezbek S., Engel J., Paulsson M., Wagener R. (2004). Interactions between the cartilage oligomeric matrix protein and matrilins. Implications for matrix assembly and the pathogenesis of chondrodysplasias. J. Biol. Chem. 279: 25294—25298. PMID 15075323 DOI:10.1074/jbc.M403778200

Див. також

• Хромосома 1