METAP1D

METAP1D
Ідентифікатори
Символи	METAP1D, MAP 1D, MAP1D, MetAP 1D, Metap1l, methionyl aminopeptidase type 1D (mitochondrial), methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial
Зовнішні ІД	OMIM: 610267 MGI: 1913809 HomoloGene: 11987 GeneCards: METAP1D
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • aminopeptidase activity • metalloexopeptidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • metalloaminopeptidase activity Клітинна компонента • мітохондрія • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • peptidyl-methionine modification • N-terminal protein amino acid modification • протеоліз • protein initiator methionine removal Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	254042	66559
Ensembl	ENSG00000172878	ENSMUSG00000041921
UniProt	Q6UB28	Q9CPW9
RefSeq (мРНК)	NM_199227 NM_001322278 NM_001322279	NM_025633
RefSeq (білок)	NP_001309207 NP_001309208 NP_954697	NP_079909
Локус (UCSC)	Хр. 2: 172 – 172.08 Mb	Хр. 2: 71.28 – 71.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

METAP1D (англ. Methionyl aminopeptidase type 1D, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 37 088.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPSGVHLL		VRRGSHRIFS		SPLNHIYLHK		QSSSQQRRNF		FFRRQRDISH
SIVLPAAVSS		AHPVPKHIKK		PDYVTTGIVP		DWGDSIEVKN		EDQIQGLHQA
CQLARHVLLL		AGKSLKVDMT		TEEIDALVHR		EIISHNAYPS		PLGYGGFPKS
VCTSVNNVLC		HGIPDSRPLQ		DGDIINIDVT		VYYNGYHGDT		SETFLVGNVD
ECGKKLVEVA		RRCRDEAIAA		CRAGAPFSVI		GNTISHITHQ		NGFQVCPHFV
GHGIGSYFHG		HPEIWHHAND		SDLPMEEGMA		FTIEPIITEG		SPEFKVLEDA
WTVVSLDNQR		SAQFEHTVLI		TSRGAQILTK		LPHEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, амінопептидаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Serero A., Giglione C., Sardini A., Martinez-Sanz J., Meinnel T. (2003). An unusual peptide deformylase features in the human mitochondrial N-terminal methionine excision pathway. J. Biol. Chem. 278: 52953—52963. PMID 14532271 DOI:10.1074/jbc.M309770200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hu X.V., Chen X., Han K.C., Mildvan A.S., Liu J.O. (2007). Kinetic and mutational studies of the number of interacting divalent cations required by bacterial and human methionine aminopeptidases. Biochemistry. 46: 12833—12843. PMID 17929833 DOI:10.1021/bi701127x

Див. також

• Хромосома 2