MSL2

MSL2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4B7Y, 4B86
Ідентифікатори
Символи	MSL2, MSL-2, MSL2L1, RNF184, male-specific lethal 2 homolog (Drosophila), MSL complex subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 614802 MGI: 1925103 HomoloGene: 10021 GeneCards: MSL2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • MSL complex Біологічний процес • histone H4-K16 acetylation • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55167	77853
Ensembl	ENSG00000174579	ENSMUSG00000066415
UniProt	Q9HCI7	Q69ZF8
RefSeq (мРНК)	NM_001145417 NM_018133	NM_001100451 NM_001379344
RefSeq (білок)	NP_001138889 NP_060603	NP_001093921 NP_001366273
Локус (UCSC)	Хр. 3: 136.15 – 136.2 Mb	Хр. 9: 100.96 – 100.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MSL2 (англ. MSL complex subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 577 амінокислот, а молекулярна маса — 62 541.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNPVNATALY		ISASRLVLNY		DPGDPKAFTE		INRLLPYFRQ		SLSCCVCGHL
LQDPIAPTNS		TCQHYVCKTC		KGKKMMMKPS		CSWCKDYEQF		EENKQLSILV
NCYKKLCEYI		TQTTLARDII		EAVDCSSDIL		ALLNDGSLFC		EETEKPSDSS
FTLCLTHSPL		PSTSEPTTDP		QASLSPMSES		TLSIAIGSSV		INGLPTYNGL
SIDRFGINIP		SPEHSNTIDV		CNTVDIKTED		LSDSLPPVCD		TVATDLCSTG
IDICSFSEDI		KPGDSLLLSV		EEVLRSLETV		SNTEVCCPNL		QPNLEATVSN
GPFLQLSSQS		LSHNVFMSTS		PALHGLSCTA		ATPKIAKLNR		KRSRSESDSE
KVQPLPISTI		IRGPTLGASA		PVTVKRESKI		SLQPIATVPN		GGTTPKISKT
VLLSTKSMKK		SHEHGSKKSH		SKTKPGILKK		DKAVKEKIPS		HHFMPGSPTK
TVYKKPQEKK		GCKCGRATQN		PSVLTCRGQR		CPCYSNRKAC		LDCICRGCQN
SYMANGEKKL		EAFAVPEKAL		EQTRLTLGIN		VTSIAVRNAS		TSTSVINVTG
SPVTTFLAAS		THDDKSLDEA		IDMRFDC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu L., Zee B.M., Wang Y., Garcia B.A., Dou Y. (2011). The RING finger protein MSL2 in the MOF complex is an E3 ubiquitin ligase for H2B K34 and is involved in crosstalk with H3 K4 and K79 methylation. Mol. Cell. 43: 132—144. PMID 21726816 DOI:10.1016/j.molcel.2011.05.015

Див. також

• Хромосома 3