MYOM1

MYOM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2R15, 2Y23, 2Y25, 3RBS
Ідентифікатори
Символи	MYOM1, SKELEMIN, myomesin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603508 MGI: 1341430 HomoloGene: 31196 GeneCards: MYOM1
Онтологія гена Молекулярна функція • structural constituent of muscle • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • identical protein binding • actin filament binding • muscle alpha-actinin binding • structural molecule activity conferring elasticity • kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • myosin filament • саркомера • striated muscle myosin thick filament • Z disc • M band • striated muscle thin filament Біологічний процес • м'язове скорочення • extraocular skeletal muscle development • striated muscle contraction • actin filament organization • sarcomere organization • striated muscle myosin thick filament assembly • GO:1901313 positive regulation of gene expression • protein kinase A signaling • positive regulation of protein secretion • skeletal muscle thin filament assembly • skeletal muscle myosin thick filament assembly • cardiac myofibril assembly • cardiac muscle tissue morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8736	17929
Ensembl	ENSG00000101605	ENSMUSG00000024049
UniProt	P52179	Q62234
RefSeq (мРНК)	NM_003803 NM_019856	NM_001083934 NM_010867
RefSeq (білок)	NP_003794 NP_062830	NP_001077403 NP_034997
Локус (UCSC)	Хр. 18: 3.07 – 3.22 Mb	Хр. 17: 71.31 – 71.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYOM1 (англ. Myomesin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 685 амінокислот, а молекулярна маса — 187 627.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLPFYQRCH		QHYDLSYRNK		DVRSTVSHYQ		REKKRSAVYT		QGSTAYSSRS
SAAHRRESEA		FRRASASSSQ		QQASQHALSS		EVSRKAASAY		DYGSSHGLTD
SSLLLDDYSS		KLSPKPKRAK		HSLLSGEEKE		NLPSDYMVPI		FSGRQKHVSG
ITDTEEERIK		EAAAYIAQRN		LLASEEGITT		SKQSTASKQT		TASKQSTASK
QSTASKQSTA		SRQSTASRQS		VVSKQATSAL		QQEETSEKKS		RKVVIREKAE
RLSLRKTLEE		TETYHAKLNE		DHLLHAPEFI		IKPRSHTVWE		KENVKLHCSI
AGWPEPRVTW		YKNQVPINVH		ANPGKYIIES		RYGMHTLEIN		GCDFEDTAQY
RASAMNVKGE		LSAYASVVVK		RYKGEFDETR		FHAGASTMPL		SFGVTPYGYA
SRFEIHFDDK		FDVSFGREGE		TMSLGCRVVI		TPEIKHFQPE		IQWYRNGVPL
SPSKWVQTLW		SGERATLTFS		HLNKEDEGLY		TIRVRMGEYY		EQYSAYVFVR
DADAEIEGAP		AAPLDVKCLE		ANKDYIIISW		KQPAVDGGSP		ILGYFIDKCE
VGTDSWSQCN		DTPVKFARFP		VTGLIEGRSY		IFRVRAVNKM		GIGFPSRVSE
PVAALDPAEK		ARLKSRPSAP		WTGQIIVTEE		EPSEGIVPGP		PTDLSVTEAT
RSYVVLSWKP		PGQRGHEGIM		YFVEKCEAGT		ENWQRVNTEL		PVKSPRFALF
DLAEGKSYCF		RVRCSNSAGV		GEPSEATEVT		VVGDKLDIPK		APGKIIPSRN
TDTSVVVSWE		ESKDAKELVG		YYIEASVAGS		GKWEPCNNNP		VKGSRFTCHG
LVTGQSYIFR		VRAVNAAGLS		EYSQDSEAIE		VKAAIGGGVS		PDVCPALSDE
PGGLTASRGR		VHEASPPTFQ		KDALLGSKPN		KPSLPSSSQN		LGQTEVSKVS
ETVQEELTPP		PQKAAPQGKS		KSDPLKKKTD		RAPPSPPCDI		TCLESFRDSM
VLGWKQPDKI		GGAEITGYYV		NYREVIDGVP		GKWREANVKA		VSEEAYKISN
LKENMVYQFQ		VAAMNMAGLG		APSAVSECFK		CEEWTIAVPG		PPHSLKCSEV
RKDSLVLQWK		PPVHSGRTPV		TGYFVDLKEA		KAKEDQWRGL		NEAAIKNVYL
KVRGLKEGVS		YVFRVRAINQ		AGVGKPSDLA		GPVVAETRPG		TKEVVVNVDD
DGVISLNFEC		DKMTPKSEFS		WSKDYVSTED		SPRLEVESKG		NKTKMTFKDL
GMDDLGIYSC		DVTDTDGIAS		SYLIDEEELK		RLLALSHEHK		FPTVPVKSEL
AVEILEKGQV		RFWMQAEKLS		GNAKVNYIFN		EKEIFEGPKY		KMHIDRNTGI
IEMFMEKLQD		EDEGTYTFQL		QDGKATNHST		VVLVGDVFKK		LQKEAEFQRQ
EWIRKQGPHF		VEYLSWEVTG		ECNVLLKCKV		ANIKKETHIV		WYKDEREISV
DEKHDFKDGI		CTLLITEFSK		KDAGIYEVIL		KDDRGKDKSR		LKLVDEAFKE
LMMEVCKKIA		LSATDLKIQS		TAEGIQLYSF		VTYYVEDLKV		NWSHNGSAIR
YSDRVKTGVT		GEQIWLQINE		PTPNDKGKYV		MELFDGKTGH		QKTVDLSGQA
YDEAYAEFQR		LKQAAIAEKN		RARVLGGLPD		VVTIQEGKAL		NLTCNVWGDP
PPEVSWLKNE		KALASDDHCN		LKFEAGRTAY		FTINGVSTAD		SGKYGLVVKN
KYGSETSDFT		VSVFIPEEEA		RMAALESLKG		GKKAK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vinkemeier U., Obermann W., Weber K., Fuerst D.O. (1993). The globular head domain of titin extends into the center of the sarcomeric M band. cDNA cloning, epitope mapping and immunoelectron microscopy of two titin-associated proteins. J. Cell Sci. 106: 319—330. PMID 7505783

Див. також

• Хромосома 18