NIP7

NIP7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1SQW, 1T5Y
Ідентифікатори
Символи	NIP7, HSPC031, KD93, CGI-37, nucleolar pre-rRNA processing protein, nucleolar pre-rRNA processing protein NIP7
Зовнішні ІД	MGI: 1913414 HomoloGene: 56743 GeneCards: NIP7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерце • preribosome, large subunit precursor • гіалоплазма Біологічний процес • ribosome biogenesis • ribosome assembly • ribosomal large subunit biogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51388	66164
Ensembl	ENSG00000132603	ENSMUSG00000031917
UniProt	Q9Y221	Q9CXK8
RefSeq (мРНК)	NM_016101 NM_001199434	NM_001164472 NM_025391
RefSeq (білок)	NP_001186363 NP_057185	NP_001157944 NP_079667
Локус (UCSC)	Хр. 16: 69.34 – 69.34 Mb	Хр. 8: 107.78 – 107.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NIP7 (англ. NIP7, nucleolar pre-rRNA processing protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 180 амінокислот, а молекулярна маса — 20 463.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRPLTEEETR		VMFEKIAKYI		GENLQLLVDR		PDGTYCFRLH		NDRVYYVSEK
IMKLAANISG		DKLVSLGTCF		GKFTKTHKFR		LHVTALDYLA		PYAKYKVWIK
PGAEQSFLYG		NHVLKSGLGR		ITENTSQYQG		VVVYSMADIP		LGFGVAAKST
QDCRKVDPMA		IVVFHQADIG		EYVRHEETLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hesling C., Oliveira C.C., Castilho B.A., Zanchin N.I. (2007). The Shwachman-Bodian-Diamond syndrome associated protein interacts with HsNip7 and its down-regulation affects gene expression at the transcriptional and translational levels. Exp. Cell Res. 313: 4180—4195. PMID 17643419 DOI:10.1016/j.yexcr.2007.06.024

Див. також

• Хромосома 16