NIPSNAP2

NIPSNAP2
Ідентифікатори
Символи	NIPSNAP2, GBAS, glioblastoma amplified sequence, nipsnap homolog 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603004 MGI: 1278343 HomoloGene: 1137 GeneCards: NIPSNAP2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of plasma membrane • мембрана • мітохондрія • цитоплазма • мітохондріальна зовнішня мембрана Біологічний процес • Окислювальне фосфорилювання • negative regulation of ATP citrate synthase activity • ATP biosynthetic process • positive regulation of high voltage-gated calcium channel activity • mitochondrion organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2631	14467
Ensembl	ENSG00000146729	ENSMUSG00000029432
UniProt	O75323	O55126
RefSeq (мРНК)	NM_001483 NM_001202469	NM_008095
RefSeq (білок)	NP_001189398 NP_001474	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 55.95 – 56 Mb	Хр. 5: 129.8 – 129.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NIPSNAP2 (англ. Nipsnap homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 286 амінокислот, а молекулярна маса — 33 743.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAARVLRARG		AAWAGGLLQR		AAPCSLLPRL		RTWTSSSNRS		REDSWLKSLF
VRKVDPRKDA		HSNLLAKKET		SNLYKLQFHN		VKPECLEAYN		KICQEVLPKI
HEDKHYPCTL		VGTWNTWYGE		QDQAVHLWRY		EGGYPALTEV		MNKLRENKEF
LEFRKARSDM		LLSRKNQLLL		EFSFWNEPVP		RSGPNIYELR		SYQLRPGTMI
EWGNYWARAI		RFRQDGNEAV		GGFFSQIGQL		YMVHHLWAYR		DLQTREDIRN
AAWHKHGWEE		LVYYTVPLIQ		EMESRIMIPL		KTSPLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Wang X.-Y., Smith D.I., Liu W., James C.D. (1998). GBAS, a novel gene encoding a protein with tyrosine phosphorylation sites and a transmembrane domain, is co-amplified with EGFR. Genomics. 49: 448—451. PMID 9615231 DOI:10.1006/geno.1998.5239
• Seroussi E., Pan H.Q., Kedra D., Roe B.A., Dumanski J.P. (1998). Characterization of the human NIPSNAP1 gene from 22q12: a member of a novel gene family. Gene. 212: 13—20. PMID 9661659 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00098-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7