NISCH

NISCH
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3P0C
Ідентифікатори
Символи	NISCH, I-1, IR1, IRAS, hIRAS, nischarin
Зовнішні ІД	OMIM: 615507 HomoloGene: 130564 GeneCards: NISCH
Онтологія гена Молекулярна функція • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • identical protein binding • structural constituent of cytoskeleton • protein kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • recycling endosome • гіалоплазма • ендосома • клітинна мембрана • early endosome • мембрана Біологічний процес • regulation of blood pressure • Rac protein signal transduction • negative regulation of cell migration • regulation of synaptic transmission, GABAergic • actin cytoskeleton organization • norepinephrine secretion • glucose metabolic process • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11188	306255
Ensembl	ENSG00000010322	ENSRNOG00000018823
UniProt	Q9Y2I1	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001276293 NM_001276294 NM_007184	NM_001376918
RefSeq (білок)	NP_001263222 NP_001263223 NP_009115	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 52.46 – 52.49 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NISCH (англ. Nischarin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 504 амінокислот, а молекулярна маса — 166 629.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATARTFGPE		REAEPAKEAR		VVGSELVDTY		TVYIIQVTDG		SHEWTVKHRY
SDFHDLHEKL		VAERKIDKNL		LPPKKIIGKN		SRSLVEKREK		DLEVYLQKLL
AAFPGVTPRV		LAHFLHFHFY		EINGITAALA		EELFEKGEQL		LGAGEVFAIG
PLQLYAVTEQ		LQQGKPTCAS		GDAKTDLGHI		LDFTCRLKYL		KVSGTEGPFG
TSNIQEQLLP		FDLSIFKSLH		QVEISHCDAK		HIRGLVASKP		TLATLSVRFS
ATSMKEVLVP		EASEFDEWEP		EGTTLEGPVT		AVIPTWQALT		TLDLSHNSVS
EIDESVKLIP		KIEFLDLSHN		GLLVVDNLQH		LYNLVHLDLS		YNKLSSLEGL
HTKLGNIKTL		NLAGNLLESL		SGLHKLYSLV		NLDLRDNRIE		QMEEVRSIGS
LPCLEHVSLL		NNPLSIIPDY		RTKVLAQFGE		RASEVCLDDT		VTTEKELDTV
EVLKAIQKAK		EVKSKLSNPE		KKGGEDSRLS		AAPCIRPSSS		PPTVAPASAS
LPQPILSNQG		IMFVQEEALA		SSLSSTDSLT		PEHQPIAQGC		SDSLESIPAG
QAASDDLRDV		PGAVGGASPE		HAEPEVQVVP		GSGQIIFLPF		TCIGYTATNQ
DFIQRLSTLI		RQAIERQLPA		WIEAANQREE		GQGEQGEEED		EEEEEEEDVA
ENRYFEMGPP		DVEEEEGGGQ		GEEEEEEEED		EEAEEERLAL		EWALGADEDF
LLEHIRILKV		LWCFLIHVQG		SIRQFAACLV		LTDFGIAVFE		IPHQESRGSS
QHILSSLRFV		FCFPHGDLTE		FGFLMPELCL		VLKVRHSENT		LFIISDAANL
HEFHADLRSC		FAPQHMAMLC		SPILYGSHTS		LQEFLRQLLT		FYKVAGGCQE
RSQGCFPVYL		VYSDKRMVQT		AAGDYSGNIE		WASCTLCSAV		RRSCCAPSEA
VKSAAIPYWL		LLTPQHLNVI		KADFNPMPNR		GTHNCRNRNS		FKLSRVPLST
VLLDPTRSCT		QPRGAFADGH		VLELLVGYRF		VTAIFVLPHE		KFHFLRVYNQ
LRASLQDLKT		VVIAKTPGTG		GSPQGSFADG		QPAERRASND		QRPQEVPAEA
LAPAPAEVPA		PAPAAASASG		PAKTPAPAEA		STSALVPEET		PVEAPAPPPA
EAPAQYPSEH		LIQATSEENQ		IPSHLPACPS		LRHVASLRGS		AIIELFHSSI
AEVENEELRH		LMWSSVVFYQ		TPGLEVTACV		LLSTKAVYFV		LHDGLRRYFS
EPLQDFWHQK		NTDYNNSPFH		ISQCFVLKLS		DLQSVNVGLF		DQHFRLTGST
PMQVVTCLTR		DSYLTHCFLQ		HLMVVLSSLE		RTPSPEPVDK		DFYSEFGNKT
TGKMENYELI		HSSRVKFTYP		SEEEIGDLTF		TVAQKMAEPE		KAPALSILLY
VQAFQVGMPP		PGCCRGPLRP		KTLLLTSSEI		FLLDEDCVHY		PLPEFAKEPP
QRDRYRLDDG		RRVRDLDRVL		MGYQTYPQAL		TLVFDDVQGH		DLMGSVTLDH
FGEVPGGPAR		ASQGREVQWQ		VFVPSAESRE		KLISLLARQW		EALCGRELPV
ELTG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ivanov T.R., Jones J.C., Dontenwill M., Bousquet P., Piletz J.E. (1998). Characterization of a partial cDNA clone detected by imidazoline receptor-selective antisera. J. Auton. Nerv. Syst. 72: 98—110. PMID 9851558 DOI:10.1016/S0165-1838(98)00094-0
• Sano H., Liu S.C.H., Lane W.S., Piletz J.E., Lienhard G.E. (2002). Insulin receptor substrate 4 associates with the protein IRAS. J. Biol. Chem. 277: 19439—19447. PMID 11912194 DOI:10.1074/jbc.M111838200
• Lim K.-P., Hong W. (2004). Human Nischarin/imidazoline receptor antisera-selected protein is targeted to the endosomes by a combined action of a PX domain and a coiled-coil region. J. Biol. Chem. 279: 54770—54782. PMID 15475348 DOI:10.1074/jbc.M411315200

Див. також

• Хромосома 3