NPTN

NPTN
Ідентифікатори
Символи	NPTN, GP55, GP65, SDFR1, SDR1, np55, np65, neuroplastin
Зовнішні ІД	OMIM: 612820 HomoloGene: 7531 GeneCards: NPTN
Онтологія гена Молекулярна функція • transmembrane transporter binding • fibroblast growth factor receptor binding • cell adhesion molecule binding • type 1 fibroblast growth factor receptor binding • cell-cell adhesion mediator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • synaptic membrane • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • inhibitory synapse • дендрит (нейробіологія) • presynaptic membrane • cell surface • аксон • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of presynaptic active zone membrane • integral component of postsynaptic density membrane • immunological synapse Біологічний процес • visual learning • positive regulation of long-term synaptic potentiation • нейробіологія розвитку • адгезія клітин • positive regulation of protein localization • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of long-term neuronal synaptic plasticity • positive regulation of neuron projection development • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • modulation of chemical synaptic transmission • synapse organization • regulation of receptor localization to synapse • excitatory synapse assembly • positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway • довготривала потенціація • axon guidance • dendrite self-avoidance • trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex, modulating synaptic transmission • GO:0032697 negative regulation of cytokine production • cellular calcium ion homeostasis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27020	56064
Ensembl	ENSG00000156642	ENSRNOG00000009029
UniProt	Q9Y639	P97546
RefSeq (мРНК)	NM_001161363 NM_001161364 NM_012428 NM_017455	NM_019380
RefSeq (білок)	NP_001154835 NP_001154836 NP_036560 NP_059429	NP_062253
Локус (UCSC)	Хр. 15: 73.56 – 73.63 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NPTN (англ. Neuroplastin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 398 амінокислот, а молекулярна маса — 44 387.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGSSLPSAL		ALSLLLVSGS		LLPGPGAAQN		AGFVKSPMSE		TKLTGDAFEL
YCDVVGSPTP		EIQWWYAEVN		RAESFRQLWD		GARKRRVTVN		TAYGSNGVSV
LRITRLTLED		SGTYECRASN		DPKRNDLRQN		PSITWIRAQA		TISVLQKPRI
VTSEEVIIRD		SPVLPVTLQC		NLTSSSHTLT		YSYWTKNGVE		LSATRKNASN
MEYRINKPRA		EDSGEYHCVY		HFVSAPKANA		TIEVKAAPDI		TGHKRSENKN
EGQDATMYCK		SVGYPHPDWI		WRKKENGMPM		DIVNTSGRFF		IINKENYTEL
NIVNLQITED		PGEYECNATN		AIGSASVVTV		LRVRSHLAPL		WPFLGILAEI
IILVVIIVVY		EKRKRPDEVP		DDDEPAGPMK		TNSTNNHKDK		NLRQRNTN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 15