NTNG2

NTNG2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3TBD, 3ZYG, 3ZYI
Ідентифікатори
Символи	NTNG2, LHLL9381, Lmnt2, NTNG1, bA479K20.1, netrin G2, NEDBASH
Зовнішні ІД	MGI: 2159341 HomoloGene: 13053 GeneCards: NTNG2
Пов'язані генетичні захворювання
системний червоний вовчак
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • anchored component of membrane • аксон • anchored component of plasma membrane • мембрана • extracellular region • гіалоплазма • клітинна мембрана • intercellular bridge • Flemming body • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • anchored component of presynaptic active zone membrane Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • аксоноґенеза • нейробіологія розвитку • modulation of chemical synaptic transmission • postsynaptic specialization assembly • synaptic membrane adhesion • regulation of presynapse assembly • motor neuron axon guidance • animal organ morphogenesis • гістогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84628	171171
Ensembl	ENSG00000196358	ENSMUSG00000035513
UniProt	Q96CW9	Q8R4F1
RefSeq (мРНК)	NM_032536	NM_133500 NM_133501 NM_001305805
RefSeq (білок)	NP_115925	NP_001292734 NP_598007 NP_598008
Локус (UCSC)	Хр. 9: 132.16 – 132.24 Mb	Хр. 2: 29.08 – 29.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NTNG2 (англ. Netrin G2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 530 амінокислот, а молекулярна маса — 59 799.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLHLLALFLH		CLPLASGDYD		ICKSWVTTDE		GPTWEFYACQ		PKVMRLKDYV
KVKVEPSGIT		CGDPPERFCS		HENPYLCSNE		CDASNPDLAH		PPRLMFDKEE
EGLATYWQSI		TWSRYPSPLE		ANITLSWNKT		VELTDDVVMT		FEYGRPTVMV
LEKSLDNGRT		WQPYQFYAED		CMEAFGMSAR		RARDMSSSSA		HRVLCTEEYS
RWAGSKKEKH		VRFEVRDRFA		IFAGPDLRNM		DNLYTRLESA		KGLKEFFTLT
DLRMRLLRPA		LGGTYVQREN		LYKYFYAISN		IEVIGRCKCN		LHANLCSMRE
GSLQCECEHN		TTGPDCGKCK		KNFRTRSWRA		GSYLPLPHGS		PNACATAGSF
GNCECYGHSN		RCSYIDFLNV		VTCVSCKHNT		RGQHCQHCRL		GYYRNGSAEL
DDENVCIECN		CNQIGSVHDR		CNETGFCECR		EGAAGPKCDD		CLPTHYWRQG
CYPNVCDDDQ		LLCQNGGTCL		QNQRCACPRG		YTGVRCEQPR		CDPADDDGGL
DCDRAPGAAP		RPATLLGCLL		LLGLAARLGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brasch J., Harrison O.J., Ahlsen G., Liu Q., Shapiro L. (2011). Crystal structure of the ligand binding domain of netrin G2. J. Mol. Biol. 414: 723—734. PMID 22041449 DOI:10.1016/j.jmb.2011.10.030

Див. також

• Хромосома 9