NUP54

NUP54
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4JNU, 4JNV, 4JO7, 4JO9, 5IJO, 5IJN
Ідентифікатори
Символи	NUP54, nucleoporin 54
Зовнішні ІД	OMIM: 607607 MGI: 1920460 HomoloGene: 41169 GeneCards: NUP54
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore Клітинна компонента • Ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • Ядерна пора • nuclear pore central transport channel • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex • host cell Біологічний процес • сортування білків • mRNA transport • protein heterotetramerization • protein localization to nuclear inner membrane • protein heterooligomerization • nucleocytoplasmic transport • regulation of protein import into nucleus • protein transport • GO:0022415 viral process • protein homooligomerization • nuclear pore organization • NLS-bearing protein import into nucleus • mRNA export from nucleus • protein heterotrimerization • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	53371	269113
Ensembl	ENSG00000138750	ENSMUSG00000034826
UniProt	Q7Z3B4	Q8BTS4
RefSeq (мРНК)	NM_001278603 NM_017426	NM_183392 NM_001359995
RefSeq (білок)	NP_001265532 NP_059122	NP_899248 NP_001346924
Локус (UCSC)	Хр. 4: 76.11 – 76.15 Mb	Хр. 5: 92.56 – 92.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP54 (англ. Nucleoporin 54) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 507 амінокислот, а молекулярна маса — 55 435.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAFNFGAPSG		TSGTAAATAA		PAGGFGGFGT		TSTTAGSAFS		FSAPTNTGTT
GLFGGTQNKG		FGFGTGFGTT		TGTSTGLGTG		LGTGLGFGGF		NTQQQQQTTL
GGLFSQPTQA		PTQSNQLINT		ASALSAPTLL		GDERDAILAK		WNQLQAFWGT
GKGYFNNNIP		PVEFTQENPF		CRFKAVGYSC		MPSNKDEDGL		VVLVFNKKET
EIRSQQQQLV		ESLHKVLGGN		QTLTVNVEGT		KTLPDDQTEV		VIYVVERSPN
GTSRRVPATT		LYAHFEQANI		KTQLQQLGVT		LSMTRTELSP		AQIKQLLQNP
PAGVDPIIWE		QAKVDNPDSE		KLIPVPMVGF		KELLRRLKVQ		DQMTKQHQTR
LDIISEDISE		LQKNQTTSVA		KIAQYKRKLM		DLSHRTLQVL		IKQEIQRKSG
YAIQADEEQL		RVQLDTIQGE		LNAPTQFKGR		LNELMSQIRM		QNHFGAVRSE
ERYYIDADLL		REIKQHLKQQ		QEGLSHLISI		IKDDLEDIKL		VEHGLNETIH
IRGGVFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Див. також

• Хромосома 4