NUPL2

NUPL2
Ідентифікатори
Символи	NUP42, CG1, NLP-1, NLP_1, hCG1, nucleoporin like 2, NUPL2, nucleoporin 42
Зовнішні ІД	MGI: 2387631 HomoloGene: 40573 GeneCards: NUP42
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclear export signal receptor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • Ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • Ядерна пора • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • host cell Біологічний процес • mRNA transport • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • protein export from nucleus • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11097	231042
Ensembl	ENSG00000136243	ENSMUSG00000048439
UniProt	O15504	Q8CIC2
RefSeq (мРНК)	NM_007342 NM_001370443 NM_001370444 NM_001370445 NM_001370446	NM_153092 NM_001346582
RefSeq (білок)	NP_031368 NP_001357372 NP_001357373 NP_001357374 NP_001357375	NP_001333511 NP_694732
Локус (UCSC)	Хр. 7: 23.18 – 23.2 Mb	Хр. 5: 24.37 – 24.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUPL2 (англ. Nucleoporin like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 423 амінокислот, а молекулярна маса — 44 872.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAICQFFLQG		RCRFGDRCWN		EHPGARGAGG		GRQQPQQQPS		GNNRRGWNTT
SQRYSNVIQP		SSFSKSTPWG		GSRDQEKPYF		SSFDSGASTN		RKEGFGLSEN
PFASLSPDEQ		KDEKKLLEGI		VKDMEVWESS		GQWMFSVYSP		VKKKPNISGF
TDISPEELRL		EYHNFLTSNN		LQSYLNSVQR		LINQWRNRVN		ELKSLNISTK
VALLSDVKDG		VNQAAPAFGF		GSSQAATFMS		PGFPVNNSSS		DNAQNFSFKT
NSGFAAASSG		SPAGFGSSPA		FGAAASTSSG		ISTSAPAFGF		GKPEVTSAAS
FSFKSPAASS		FGSPGFSGLP		ASLATGPVRA		PVAPAFGGGS		SVAGFGSPGS
HSHTAFSKPS		SDTFGNSSIS		TSLSASSSII		ATDNVLFTPR		DKLTVEELEQ
FQSKKFTLGK		IPLKPPPLEL		LNV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Farjot G., Sergeant A., Mikaelian I. (1999). A new nucleoporin-like protein interacts with both HIV-1 Rev nuclear export signal and CRM-1. J. Biol. Chem. 274: 17309—17317. PMID 10358091 DOI:10.1074/jbc.274.24.17309
• Kendirgi F., Rexer D.J., Alcazar-Roman A.R., Onishko H.M., Wente S.R. (2005). Interaction between the shuttling mRNA export factor Gle1 and the nucleoporin hCG1: a conserved mechanism in the export of Hsp70 mRNA. Mol. Biol. Cell. 16: 4304—4315. PMID 16000379 DOI:10.1091/mbc.E04-11-0998

Див. також

• Хромосома 7