OAT

OAT
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GBN, 1OAT, 2BYJ, 2BYL, 2CAN, 2OAT
Ідентифікатори
Символи	OAT, GACR, HOGA, OATASE, OKT, ornithine aminotransferase
Зовнішні ІД	OMIM: 613349 MGI: 97394 HomoloGene: 231 GeneCards: OAT
Пов'язані генетичні захворювання
gyrate atrophy of the choroid
Онтологія гена Молекулярна функція • каталітична активність • identical protein binding • pyridoxal phosphate binding • transferase activity • transaminase activity • ornithine-oxo-acid transaminase activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондріальний матрикс • нуклеоплазма • мітохондрія Біологічний процес • L-proline biosynthetic process • зір • cellular amino acid biosynthetic process • protein hexamerization • arginine catabolic process to proline via ornithine • arginine catabolic process to glutamate Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4942	18242
Ensembl	ENSG00000065154	ENSMUSG00000030934
UniProt	P04181	P29758
RefSeq (мРНК)	NM_000274 NM_001171814 NM_001322965 NM_001322966 NM_001322967 NM_001322968 NM_001322969 NM_001322970 NM_001322971 NM_001322974	NM_016978
RefSeq (білок)	NP_000265 NP_001165285 NP_001309894 NP_001309895 NP_001309896 NP_001309897 NP_001309898 NP_001309899 NP_001309900 NP_001309903	NP_058674
Локус (UCSC)	Хр. 10: 124.4 – 124.42 Mb	Хр. 7: 132.16 – 132.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OAT (англ. Ornithine aminotransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 48 535.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSKLAHLQR		FAVLSRGVHS		SVASATSVAT		KKTVQGPPTS		DDIFEREYKY
GAHNYHPLPV		ALERGKGIYL		WDVEGRKYFD		FLSSYSAVNQ		GHCHPKIVNA
LKSQVDKLTL		TSRAFYNNVL		GEYEEYITKL		FNYHKVLPMN		TGVEAGETAC
KLARKWGYTV		KGIQKYKAKI		VFAAGNFWGR		TLSAISSSTD		PTSYDGFGPF
MPGFDIIPYN		DLPALERALQ		DPNVAAFMVE		PIQGEAGVVV		PDPGYLMGVR
ELCTRHQVLF		IADEIQTGLA		RTGRWLAVDY		ENVRPDIVLL		GKALSGGLYP
VSAVLCDDDI		MLTIKPGEHG		STYGGNPLGC		RVAIAALEVL		EEENLAENAD
KLGIILRNEL		MKLPSDVVTA		VRGKGLLNAI		VIKETKDWDA		WKVCLRLRDN
GLLAKPTHGD		IIRFAPPLVI		KEDELRESIE		IINKTILSF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, амінотрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Ramesh V., Shaffer M.M., Allaire J.M., Shih V.E., Gusella J.F. (1986). Investigation of gyrate atrophy using a cDNA clone for human ornithine aminotransferase. DNA. 5: 493—501. PMID 3816496 DOI:10.1089/dna.1.1986.5.493
• Kobayashi T., Nishii M., Takagi Y., Titani T., Matsuzawa T. (1989). Molecular cloning and nucleotide sequence analysis of mRNA for human kidney ornithine aminotransferase. An examination of ornithine aminotransferase isozymes between liver and kidney. FEBS Lett. 255: 300—304. PMID 2507357 DOI:10.1016/0014-5793(89)81110-X
• Zintz C.B., Inana G. (1990). Analysis of the human ornithine aminotransferase gene family. Exp. Eye Res. 50: 759—770. PMID 2373169 DOI:10.1016/0014-4835(90)90126-F
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Simmaco M., John R.A., Barra D., Bossa F. (1986). The primary structure of ornithine aminotransferase. Identification of active-site sequence and site of post-translational proteolysis. FEBS Lett. 199: 39—42. PMID 3754226 DOI:10.1016/0014-5793(86)81219-4
• Shah S.A., Shen B.W., Brunger A.T. (1997). Human ornithine aminotransferase complexed with L-canaline and gabaculine: structural basis for substrate recognition. Structure. 5: 1067—1075. PMID 9309222 DOI:10.1016/S0969-2126(97)00258-X

Див. також

• Хромосома 10