ODC1

ODC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OO0, 4ZGY, 5BWA, 1D7K, 2ON3
Ідентифікатори
Символи	ODC1, ODC, ornithine decarboxylase 1, NEDBIA, BABS, NEDBA
Зовнішні ІД	OMIM: 165640 MGI: 97402 HomoloGene: 1906 GeneCards: ODC1
Реагує на сполуку
ефлорнітин
Онтологія гена Молекулярна функція • ornithine decarboxylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • carboxy-lyase activity • каталітична активність • lyase activity Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • цитоплазма • компонент клітини Біологічний процес • putrescine biosynthetic process • polyamine biosynthetic process • response to virus • polyamine metabolic process • regulation of cellular amino acid metabolic process • positive regulation of cell population proliferation • розвиток нирки • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • putrescine biosynthetic process from ornithine Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4953	18263
Ensembl	ENSG00000115758	ENSMUSG00000011179
UniProt	P11926	P00860
RefSeq (мРНК)	NM_002539 NM_001287188 NM_001287189 NM_001287190	NM_013614
RefSeq (білок)	NP_001274117 NP_001274118 NP_001274119 NP_002530	NP_038642
Локус (UCSC)	Хр. 2: 10.44 – 10.45 Mb	Хр. 12: 17.59 – 17.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ODC1 (англ. Ornithine decarboxylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот, а молекулярна маса — 51 148.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNNFGNEEFD		CHFLDEGFTA		KDILDQKINE		VSSSDDKDAF		YVADLGDILK
KHLRWLKALP		RVTPFYAVKC		NDSKAIVKTL		AATGTGFDCA		SKTEIQLVQS
LGVPPERIIY		ANPCKQVSQI		KYAANNGVQM		MTFDSEVELM		KVARAHPKAK
LVLRIATDDS		KAVCRLSVKF		GATLRTSRLL		LERAKELNID		VVGVSFHVGS
GCTDPETFVQ		AISDARCVFD		MGAEVGFSMY		LLDIGGGFPG		SEDVKLKFEE
ITGVINPALD		KYFPSDSGVR		IIAEPGRYYV		ASAFTLAVNI		IAKKIVLKEQ
TGSDDEDESS		EQTFMYYVND		GVYGSFNCIL		YDHAHVKPLL		QKRPKPDEKY
YSSSIWGPTC		DGLDRIVERC		DLPEMHVGDW		MLFENMGAYT		VAAASTFNGF
QRPTIYYVMS		GPAWQLMQQF		QNPDFPPEVE		EQDASTLPVS		CAWESGMKRH
RAACASASIN		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.

Література

• Hickok N.J., Seppaenen P.J., Gunsalus G.L., Jaenne O.A. (1987). Complete amino acid sequence of human ornithine decarboxylase deduced from complementary DNA. DNA. 6: 179—187. PMID 3595418 DOI:10.1089/dna.1987.6.179
• Fitzgerald M.C., Flanagan M.A. (1989). Characterization and sequence analysis of the human ornithine decarboxylase gene. DNA. 8: 623—634. PMID 2693021 DOI:10.1089/dna.1.1989.8.623
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kaczmarek L., Calabretta B., Ferrari S., de Riel J.K. (1987). Cell-cycle-dependent expression of human ornithine decarboxylase. J. Cell. Physiol. 132: 545—551. PMID 3308908 DOI:10.1002/jcp.1041320318
• Bauer P.M., Fukuto J.M., Buga G.M., Pegg A.E., Ignarro L.J. (1999). Nitric oxide inhibits ornithine decarboxylase by S-nitrosylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 262: 355—358. PMID 10462479 DOI:10.1006/bbrc.1999.1210
• Bauer P.M., Buga G.M., Fukuto J.M., Pegg A.E., Ignarro L.J. (2001). Nitric oxide inhibits ornithine decarboxylase via S-nitrosylation of cysteine 360 in the active site of the enzyme. J. Biol. Chem. 276: 34458—34464. PMID 11461922 DOI:10.1074/jbc.M105219200

Див. також

• Хромосома 2