OTOP1

OTOP1
Ідентифікатори
Символи	OTOP1, otopetrin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607806 MGI: 2388363 HomoloGene: 35244 GeneCards: OTOP1
Онтологія гена Молекулярна функція • proton channel activity Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • biomineral tissue development • ion transport • cellular response to insulin stimulus • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • proton transmembrane transport • detection of gravity • inner ear morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	133060	21906
Ensembl	ENSG00000163982	ENSMUSG00000051596
UniProt	Q7RTM1	Q80VM9
RefSeq (мРНК)	NM_177998	NM_172709 NM_178139
RefSeq (білок)	NP_819056	NP_766297
Локус (UCSC)	Хр. 4: 4.19 – 4.23 Mb	Хр. 5: 38.43 – 38.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTOP1 (англ. Otopetrin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 612 амінокислот, а молекулярна маса — 67 353.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLEGLGSPAS		PRAAASASVA		GSSGPAACSP		PSSSAPRSPE		SPAPRRGGVR
ASVPQKLAEM		LSSQYGLIVF		VAGLLLLLAW		AVHAAGVSKS		DLLCFLTALM
LLQLLWMLWY		VGRSSAHRRL		FRLKDTHAGA		GWLRGSITLF		AVITVILGCL
KIGYFIGFSE		CLSATEGVFP		VTHSVHTLLQ		VYFLWGHAKD		IIQSFKTLER
FGVIHSVFTN		LLLWANGVLN		ESKHQLNEHK		ERLITLGFGN		ITTVLDDHTP
QCNCTPPTLC		TAISHGIYYL		YPFNIEYQIL		ASTMLYVLWK		NIGRKVDSHQ
HQKMQFKSDG		VMVGAVLGLT		VLAATIAVVV		VYLIHIGRSK		TKSESALIMF
YLYAITLLML		MGAAGLAGIR		IYRIDEKSLD		ESKNPARKLD		SDLLVGTASG
SWLISWGSIL		AILCAEGHPR		YTWYNLPYSI		LAIVEKYIQN		LFIFESIHRE
PEKLSEDIQT		LRVVTVCNGN		TMPLASSCPK		SGGVARDVAP		QGKDMPPAAN
GNVCMRESHD		KEEEKQEESS		WGGSPSPVRL		PRFLQGNAKR		KVLRNIAAFL
FLCNISLWIP		PAFGCRPEYD		NGLEEIVFGF		EPWIIVVNLA		MPFSIFYRMH
AAASLFEVYC		KI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4