PARP16

PARP16
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4F0D
Ідентифікатори
Символи	PARP16, ARTD15, C15orf30, pART15, poly(ADP-ribose) polymerase family member 16
Зовнішні ІД	MGI: 2446133 HomoloGene: 9878 GeneCards: PARP16
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • kinase binding; • protein serine/threonine kinase activator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • glycosyltransferase activity; • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity; • protein ADP-ribosylase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • nuclear envelope; • ендоплазматичний ретикулум; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • endoplasmic reticulum tubular network; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• Відповідь на незгорнуті білки; • protein auto-ADP-ribosylation; • response to unfolded protein; • protein ADP-ribosylation; • negative regulation of cell death; • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity; • NAD biosynthesis via nicotinamide riboside salvage pathway; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • IRE1-mediated unfolded protein response; • protein mono-ADP-ribosylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54956
	214424
	ENSG00000138617
	ENSMUSG00000032392
	Q8N5Y8
	Q7TMM8
	NM_017851; NM_001316943; NM_001316944
	NM_177460
	NP_001303872; NP_001303873; NP_060321
	NP_803411
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PARP16 (англ. Poly(ADP-ribose) polymerase family member 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 322 амінокислот, а молекулярна маса — 36 383^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQPSGWAAAR	EAAGRDMLAA	DLRCSLFASA	LQSYKRDSVL	RPFPASYARG
DCKDFEALLA	DASKLPNLKE	LLQSSGDNHK	RAWDLVSWIL	SSKVLTIHSA
GKAEFEKIQK	LTGAPHTPVP	APDFLFEIEY	FDPANAKFYE	TKGERDLIYA
FHGSRLENFH	SIIHNGLHCH	LNKTSLFGEG	TYLTSDLSLA	LIYSPHGHGW
QHSLLGPILS	CVAVCEVIDH	PDVKCQTKKK	DSKEIDRRRA	RIKHSEGGDI
PPKYFVVTNN	QLLRVKYLLV	YSQKPPKRAS	SQLSWFSSHW	FTVMISLYLL
LLLIVSVINS	SAFQHFWNRA	KR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на порушення конформації білку, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hottiger M.O., Hassa P.O., Luscher B., Schuler H., Koch-Nolte F. (2010). Toward a unified nomenclature for mammalian ADP-ribosyltransferases. Trends Biochem. Sci. 35: 208—219. PMID 20106667 DOI:10.1016/j.tibs.2009.12.003
Jwa M., Chang P. (2012). PARP16 is a tail-anchored endoplasmic reticulum protein required for the PERK-and IRE1alpha-mediated unfolded protein response. Nat. Cell Biol. 14: 1223—1230. PMID 23103912 DOI:10.1038/ncb2593
Di Paola S., Micaroni M., Di Tullio G., Buccione R., Di Girolamo M. (2012). PARP16/ARTD15 is a novel endoplasmic-reticulum-associated mono-ADP-ribosyltransferase that interacts with, and modifies karyopherin-beta1. PLoS ONE. 7: E37352—E37352. PMID 22701565 DOI:10.1371/journal.pone.0037352
Karlberg T., Thorsell A.G., Kallas A., Schuler H. (2012). Crystal structure of human ADP-ribose transferase ARTD15/PARP16 reveals a novel putative regulatory domain. J. Biol. Chem. 287: 24077—24081. PMID 22661712 DOI:10.1074/jbc.M112.379289