PATJ

PATJ
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1VF6, 2D92, 2DAZ, 2DB5, 2DLU, 2DM8, 2DMZ, 2EHR, 4Q2N
Ідентифікатори
Символи	PATJ, Cipp, InaD-like, hINADL, INADL, crumbs cell polarity complex component, PATJ crumbs cell polarity complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 603199 MGI: 1277960 HomoloGene: 72199 GeneCards: PATJ
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинна мембрана • apical part of cell • екзосома • apical plasma membrane • мембрана • bicellular tight junction • центросома • Центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • Міжклітинні контакти • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • bicellular tight junction assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10207	12695
Ensembl	ENSG00000132849	ENSMUSG00000061859
UniProt	Q8NI35	Q63ZW7
RefSeq (мРНК)	NM_005799 NM_176877 NM_176878 NM_001350145	NM_001005784 NM_001005787 NM_007704 NM_172696 NM_001355177
RefSeq (білок)	NP_795352 NP_001337074	NP_001005784 NP_001005787 NP_031730 NP_766284 NP_001342106
Локус (UCSC)	Хр. 1: 61.74 – 62.18 Mb	Хр. 4: 98.28 – 98.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PATJ (англ. PATJ, crumbs cell polarity complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 801 амінокислот, а молекулярна маса — 196 368.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPENPATDKL		QVLQVLDRLK		MKLQEKGDTS		QNEKLSMFYE		TLKSPLFNQI
LTLQQSIKQL		KGQLNHIPSD		CSANFDFSRK		GLLVFTDGSI		TNGNVHRPSN
NSTVSGLFPW		TPKLGNEDFN		SVIQQMAQGR		QIEYIDIERP		STGGLGFSVV
ALRSQNLGKV		DIFVKDVQPG		SVADRDQRLK		ENDQILAINH		TPLDQNISHQ
QAIALLQQTT		GSLRLIVARE		PVHTKSSTSS		SLNDTTLPET		VCWGHVEEVE
LINDGSGLGF		GIVGGKTSGV		VVRTIVPGGL		ADRDGRLQTG		DHILKIGGTN
VQGMTSEQVA		QVLRNCGNSV		RMLVARDPAG		DISVTPPAPA		ALPVALPTVA
SKGPGSDSSL		FETYNVELVR		KDGQSLGIRI		VGYVGTSHTG		EASGIYVKSI
IPGSAAYHNG		HIQVNDKIVA		VDGVNIQGFA		NHDVVEVLRN		AGQVVHLTLV
RRKTSSSTSP		LEPPSDRGTV		VEPLKPPALF		LTGAVETETN		VDGEDEEIKE
RIDTLKNDNI		QALEKLEKVP		DSPENELKSR		WENLLGPDYE		VMVATLDTQI
ADDAELQKYS		KLLPIHTLRL		GVEVDSFDGH		HYISSIVSGG		PVDTLGLLQP
EDELLEVNGM		QLYGKSRREA		VSFLKEVPPP		FTLVCCRRLF		DDEASVDEPR
RTETSLPETE		VDHNMDVNTE		EDDDGELALW		SPEVKIVELV		KDCKGLGFSI
LDYQDPLDPT		RSVIVIRSLV		ADGVAERSGG		LLPGDRLVSV		NEYCLDNTSL
AEAVEILKAV		PPGLVHLGIC		KPLVEDNEEE		SCYILHSSSN		EDKTEFSGTI
HDINSSLILE		APKGFRDEPY		FKEELVDEPF		LDLGKSFHSQ		QKEIEQSKEA
WEMHEFLTPR		LQEMDEEREI		LVDEEYELYQ		DPSPSMELYP		LSHIQEATPV
PSVNELHFGT		QWLHDNEPSE		SQEARTGRTV		YSQEAQPYGY		CPENVMKENF
VMESLPSVPS		TEGNSQQGRF		DDLENLNSLA		KTSLDLGMIP		NDVQGPSLLI
DLPVVAQRRE		QEDLPLYQHQ		ATRVISKASA		YTGMLSSRYA		TDTCELPERE
EGEGEETPNF		SHWGPPRIVE		IFREPNVSLG		ISIVGGQTVI		KRLKNGEELK
GIFIKQVLED		SPAGKTNALK		TGDKILEVSG		VDLQNASHSE		AVEAIKNAGN
PVVFIVQSLS		STPRVIPNVH		NKANKITGNQ		NQDTQEKKEK		RQGTAPPPMK
LPPPYKALTD		DSDENEEEDA		FTDQKIRQRY		ADLPGELHII		ELEKDKNGLG
LSLAGNKDRS		RMSIFVVGIN		PEGPAAADGR		MRIGDELLEI		NNQILYGRSH
QNASAIIKTA		PSKVKLVFIR		NEDAVNQMAV		TPFPVPSSSP		SSIEDQSGTE
PISSEEDGSV		EVGIKQLPES		ESFKLAVSQM		KQQKYPTKVS		FSSQEIPLAP
ASSYHSTDAD		FTGYGGFQAP		LSVDPATCPI		VPGQEMIIEI		SKGRSGLGLS
IVGGKDTPLN		AIVIHEVYEE		GAAARDGRLW		AGDQILEVNG		VDLRNSSHEE
AITALRQTPQ		KVRLVVYRDE		AHYRDEENLE		IFPVDLQKKA		GRGLGLSIVG
KRNGSGVFIS		DIVKGGAADL		DGRLIQGDQI		LSVNGEDMRN		ASQETVATIL
KCAQGLVQLE		IGRLRAGSWT		SARTTSQNSQ		GSQQSAHSSC		HPSFAPVITG
LQNLVGTKRV		SDPSQKNSGT		DMEPRTVEIN		RELSDALGIS		IAGGRGSPLG
DIPVFIAMIQ		ASGVAARTQK		LKVGDRIVSI		NGQPLDGLSH		ADVVNLLKNA
YGRIILQVVA		DTNISAIAAQ		LENMSTGYHL		GSPTAEHHPE		DTEEQLQMTA
D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• Philipp S., Flockerzi V. (1997). Molecular characterization of a novel PDZ domain protein with homology to INAD from Drosophila melanogaster. FEBS Lett. 413: 243—248. PMID 9280290 DOI:10.1016/S0014-5793(97)00877-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Roh M.H., Liu C.-J., Laurinec S., Margolis B. (2002). The carboxyl terminus of zona occludens-3 binds and recruits a mammalian homologue of discs lost to tight junctions. J. Biol. Chem. 277: 27501—27509. PMID 12021270 DOI:10.1074/jbc.M201177200
• Nakajima H., Tanoue T. (2011). Lulu2 regulates the circumferential actomyosin tensile system in epithelial cells through p114RhoGEF. J. Cell Biol. 195: 245—261. PMID 22006950 DOI:10.1083/jcb.201104118
• Li Y., Karnak D., Demeler B., Margolis B., Lavie A. (2004). Structural basis for L27 domain-mediated assembly of signaling and cell polarity complexes. EMBO J. 23: 2723—2733. PMID 15241471 DOI:10.1038/sj.emboj.7600294

Див. також

• Хромосома 1