PCBP4

PCBP4
Ідентифікатори
Символи	PCBP4, CBP, LIP4, MCG10, poly(rC) binding protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 608503 MGI: 1890471 HomoloGene: 56926 GeneCards: PCBP4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleic acid binding • mRNA 3'-UTR binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • regulation of mRNA stability Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57060	59092
Ensembl	ENSG00000090097	ENSMUSG00000023495
UniProt	P57723	P57724
RefSeq (мРНК)	NM_001174100 NM_020418 NM_033008 NM_033009 NM_033010	NM_021567
RefSeq (білок)	NP_001167571 NP_065151 NP_127501 NP_127503 NP_001350814	NP_067542
Локус (UCSC)	Хр. 3: 51.96 – 51.97 Mb	Хр. 9: 106.45 – 106.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCBP4 (англ. Poly(rC) binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 403 амінокислот, а молекулярна маса — 41 482.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGSDGGLEE		EPELSITLTL		RMLMHGKEVG		SIIGKKGETV		KRIREQSSAR
ITISEGSCPE		RITTITGSTA		AVFHAVSMIA		FKLDEDLCAA		PANGGNVSRP
PVTLRLVIPA		SQCGSLIGKA		GTKIKEIRET		TGAQVQVAGD		LLPNSTERAV
TVSGVPDAII		LCVRQICAVI		LESPPKGATI		PYHPSLSLGT		VLLSANQGFS
VQGQYGAVTP		AEVTKLQQLS		SHAVPFATPS		VVPGLDPGTQ		TSSQEFLVPN
DLIGCVIGRQ		GSKISEIRQM		SGAHIKIGNQ		AEGAGERHVT		ITGSPVSIAL
AQYLITACLE		TAKSTSGGTP		SSAPADLPAP		FSPPLTALPT		APPGLLGTPY
AISLSNFIGL		KPMPFLALPP		ASPGPPPGLA		AYTAKMAAAN		GSKKAERQKF
SPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Makeyev A.V., Liebhaber S.A. (2000). Identification of two novel mammalian genes establishes a subfamily of KH-domain RNA-binding proteins. Genomics. 67: 301—316. PMID 10936052 DOI:10.1006/geno.2000.6244
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chkheidze A.N., Liebhaber S.A. (2003). A novel set of nuclear localization signals determine distributions of the alphaCP RNA-binding proteins. Mol. Cell. Biol. 23: 8405—8415. PMID 14612387 DOI:10.1128/MCB.23.23.8405-8415.2003

Див. також

• Хромосома 3