PCDH10

PCDH10
Ідентифікатори
Символи	PCDH10, OL-PCDH, PCDH19, protocadherin 10
Зовнішні ІД	OMIM: 608286 MGI: 1338042 HomoloGene: 74967 GeneCards: PCDH10
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57575	18526
Ensembl	ENSG00000138650	ENSMUSG00000049100
UniProt	Q9P2E7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_020815 NM_032961	NM_001098170 NM_001098171 NM_001098172 NM_011043
RefSeq (білок)	NP_065866 NP_116586	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 4: 133.15 – 133.21 Mb	Хр. 3: 45.33 – 45.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDH10 (англ. Protocadherin 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 112 936.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIVLLLFALL		WMVEGVFSQL		HYTVQEEQEH		GTFVGNIAED		LGLDITKLSA
RGFQTVPNSR		TPYLDLNLET		GVLYVNEKID		REQICKQSPS		CVLHLEVFLE
NPLELFQVEI		EVLDINDNPP		SFPEPDLTVE		ISESATPGTR		FPLESAFDPD
VGTNSLRDYE		ITPNSYFSLD		VQTQGDGNRF		AELVLEKPLD		REQQAVHRYV
LTAVDGGGGG		GVGEGGGGGG		GAGLPPQQQR		TGTALLTIRV		LDSNDNVPAF
DQPVYTVSLP		ENSPPGTLVI		QLNATDPDEG		QNGEVVYSFS		SHISPRAREL
FGLSPRTGRL		EVSGELDYEE		SPVYQVYVQA		KDLGPNAVPA		HCKVLVRVLD
ANDNAPEISF		STVKEAVSEG		AAPGTVVALF		SVTDRDSEEN		GQVQCELLGD
VPFRLKSSFK		NYYTIVTEAP		LDREAGDSYT		LTVVARDRGE		PALSTSKSIQ
VQVSDVNDNA		PRFSQPVYDV		YVTENNVPGA		YIYAVSATDR		DEGANAQLAY
SILECQIQGM		SVFTYVSINS		ENGYLYALRS		FDYEQLKDFS		FQVEARDAGS
PQALAGNATV		NILIVDQNDN		APAIVAPLPG		RNGTPAREVL		PRSAEPGYLL
TRVAAVDADD		GENARLTYSI		VRGNEMNLFR		MDWRTGELRT		ARRVPAKRDP
QRPYELVIEV		RDHGQPPLSS		TATLVVQLVD		GAVEPQGGGG		SGGGGSGEHQ
RPSRSGGGET		SLDLTLILII		ALGSVSFIFL		LAMIVLAVRC		QKEKKLNIYT
CLASDCCLCC		CCCGGGGSTC		CGRQARARKK		KLSKSDIMLV		QSSNVPSNPA
QVPIEESGGF		GSHHHNQNYC		YQVCLTPESA		KTDLMFLKPC		SPSRSTDTEH
NPCGAIVTGY		TDQQPDIISN		GSILSNETKH		QRAELSYLVD		RPRRVNSSAF
QEADIVSSKD		SGHGDSEQGD		SDHDATNRAQ		SAGMDLFSNC		TEECKALGHS
DRCWMPSFVP		SDGRQAADYR		SNLHVPGMDS		VPDTEVFETP		EAQPGAERSF
STFGKEKALH		STLERKELDG		LLTNTRAPYK		PPYLTRKRIC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Wolverton T., Lalande M. (2001). Identification and characterization of three members of a novel subclass of protocadherins. Genomics. 76: 66—72. PMID 11549318 DOI:10.1006/geno.2001.6592

Див. також

• Хромосома 4